More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1290 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  84.38 
 
 
194 aa  315  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  64.55 
 
 
201 aa  257  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  63.78 
 
 
209 aa  257  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  69.35 
 
 
202 aa  256  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  63.83 
 
 
198 aa  252  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  62.37 
 
 
195 aa  242  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  60.22 
 
 
197 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  74.75 
 
 
202 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  64.32 
 
 
189 aa  237  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  67.72 
 
 
191 aa  234  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  62.05 
 
 
198 aa  234  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  58.12 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  61.86 
 
 
205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  66.67 
 
 
195 aa  228  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  57.81 
 
 
213 aa  226  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  59.56 
 
 
213 aa  221  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  62.96 
 
 
206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  61.98 
 
 
196 aa  218  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  59.57 
 
 
199 aa  218  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  63.55 
 
 
206 aa  218  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  58.76 
 
 
199 aa  216  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  60.94 
 
 
196 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  54.97 
 
 
192 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  54.97 
 
 
192 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  54.97 
 
 
192 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  54.26 
 
 
196 aa  204  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  59.3 
 
 
202 aa  203  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  61.05 
 
 
195 aa  202  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  64.02 
 
 
204 aa  201  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  53.93 
 
 
192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  52.88 
 
 
192 aa  191  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  58.03 
 
 
194 aa  188  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  57.07 
 
 
221 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  51.83 
 
 
191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  46.28 
 
 
188 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.1 
 
 
199 aa  174  8e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
185 aa  171  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  50.81 
 
 
188 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  43.08 
 
 
199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
185 aa  159  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 
214 aa  158  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 
214 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
217 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 
193 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  43.37 
 
 
198 aa  152  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
193 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
179 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
205 aa  148  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  44.21 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  44.74 
 
 
201 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  44.74 
 
 
204 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 
202 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
207 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 
204 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 
195 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  42.61 
 
 
185 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
207 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
207 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
207 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
190 aa  142  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
186 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
186 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 
196 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 
183 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  44.21 
 
 
207 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 
186 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 
186 aa  140  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 
186 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 
213 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 
186 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 
189 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  35.68 
 
 
186 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 
192 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 
192 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 
192 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  35.33 
 
 
193 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
232 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 
192 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  36.51 
 
 
189 aa  136  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  39.68 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 
184 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 
195 aa  135  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.11 
 
 
191 aa  135  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 
207 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 
230 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  37.19 
 
 
201 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
198 aa  134  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 
193 aa  134  8e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>