More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2606 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  71.64 
 
 		 203 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  69.65 
 
 		 203 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  66.17 
 
 		 202 aa  277  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  65.35 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  64.85 
 
 		 210 aa  268  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  64.85 
 
 		 210 aa  268  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  63.54 
 
 		 201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  59.41 
 
 		 204 aa  252  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  58.91 
 
 		 206 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  62.5 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  58.38 
 
 		 207 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  58.97 
 
 		 202 aa  245  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  60.94 
 
 		 201 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  60.44 
 
 		 196 aa  230  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  55.67 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  57.75 
 
 		 192 aa  224  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  57.67 
 
 		 205 aa  221  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  52.24 
 
 		 239 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  57.84 
 
 		 225 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  58.38 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  57.84 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  55.14 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  50.52 
 
 		 192 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  56.59 
 
 		 243 aa  201  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  55.68 
 
 		 235 aa  201  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  47.92 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2768  peptidyl-tRNA hydrolase  51.24 
 
 		 243 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3032  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 		 243 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1536  peptidyl-tRNA hydrolase  52.91 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0717803  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1485  peptidyl-tRNA hydrolase  52.91 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  53.51 
 
 		 248 aa  190  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1630  peptidyl-tRNA hydrolase  54.11 
 
 		 251 aa  188  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.144518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3190  peptidyl-tRNA hydrolase  52.43 
 
 		 234 aa  187  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29139  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  55.68 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  53.33 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3592  peptidyl-tRNA hydrolase  53.51 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0756  peptidyl-tRNA hydrolase  51.65 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.348899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0666  peptidyl-tRNA hydrolase  49.46 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  44.94 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  45.66 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  45.66 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  44.91 
 
 		 184 aa  151  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 195 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 196 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  43.35 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  48.24 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  47.27 
 
 		 210 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  46.2 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  44.25 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  42.67 
 
 		 182 aa  142  5e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 209 aa  140  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  47.95 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  39.68 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  43.64 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  46.2 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 189 aa  137  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  41.52 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0504  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  43.93 
 
 		 188 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  41.36 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  39.62 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.24 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  42.6 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2570  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  41.76 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  43.93 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.08 
 
 		 186 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.08 
 
 		 186 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.08 
 
 		 186 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 193 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>