More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0947 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 235 aa  480  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  67.74 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3592  peptidyl-tRNA hydrolase  67.5 
 
 		 239 aa  307  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  64.68 
 
 		 225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  63.83 
 
 		 225 aa  295  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  63.83 
 
 		 225 aa  295  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  68.91 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  64.52 
 
 		 205 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  52.77 
 
 		 239 aa  244  9e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  63.3 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  63.3 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  62.23 
 
 		 189 aa  240  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  63.44 
 
 		 191 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  62.77 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  62.16 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  59.02 
 
 		 196 aa  228  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  60.54 
 
 		 201 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  57.84 
 
 		 204 aa  228  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  59.57 
 
 		 202 aa  227  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  63.24 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  55.68 
 
 		 202 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  61.7 
 
 		 192 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  51.32 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  57.3 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  57.38 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  59.26 
 
 		 243 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1536  peptidyl-tRNA hydrolase  50.65 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0717803  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1485  peptidyl-tRNA hydrolase  50.65 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  56.76 
 
 		 207 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  55.91 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  58.06 
 
 		 189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2768  peptidyl-tRNA hydrolase  49.38 
 
 		 243 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  55.68 
 
 		 201 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1630  peptidyl-tRNA hydrolase  51.72 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.144518  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0756  peptidyl-tRNA hydrolase  55.5 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.348899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0666  peptidyl-tRNA hydrolase  54.93 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3032  peptidyl-tRNA hydrolase  57.84 
 
 		 243 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3190  peptidyl-tRNA hydrolase  50.23 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29139  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  51.35 
 
 		 193 aa  203  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  55.68 
 
 		 202 aa  201  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  48.07 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  48.88 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  45.79 
 
 		 192 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  46.96 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  45.86 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  46.11 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  46.06 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  54.66 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  45.2 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  44.63 
 
 		 193 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  54.04 
 
 		 188 aa  151  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  50.64 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  43.5 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  45.21 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  45.21 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  45.21 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  45.73 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  51.35 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  45.5 
 
 		 192 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  44.79 
 
 		 192 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  49.37 
 
 		 213 aa  148  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  53.89 
 
 		 191 aa  148  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  51.01 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  36.41 
 
 		 365 aa  144  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  39.01 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  39.01 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 		 186 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  42.37 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58488  normal  0.821965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  53.61 
 
 		 193 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  44.63 
 
 		 191 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  48.67 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  43.83 
 
 		 185 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0285  peptidyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  48.68 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0212  peptidyl-tRNA hydrolase  48.02 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.145584  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 		 182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  45.12 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.56 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  45.4 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  41.51 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  46.2 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  46.75 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  46.75 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>