More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3592 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3592  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
239 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  67.5 
 
 
235 aa  330  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  66.13 
 
 
248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  64.02 
 
 
225 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  64.02 
 
 
225 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  63.6 
 
 
225 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  61.51 
 
 
235 aa  262  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  62.37 
 
 
205 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  61.83 
 
 
191 aa  235  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  59.57 
 
 
189 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  60.54 
 
 
204 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  56.46 
 
 
210 aa  228  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  56.46 
 
 
210 aa  228  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  58.38 
 
 
202 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  59.57 
 
 
210 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  57.84 
 
 
206 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  59.57 
 
 
202 aa  224  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  55.39 
 
 
207 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  59.46 
 
 
201 aa  224  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  58.38 
 
 
207 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  61.62 
 
 
203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  55.19 
 
 
198 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  61.08 
 
 
203 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  48.33 
 
 
239 aa  215  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  59.68 
 
 
192 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  55.87 
 
 
196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_004310  BR1536  peptidyl-tRNA hydrolase  48.95 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0717803  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 
193 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1485  peptidyl-tRNA hydrolase  48.95 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  56.45 
 
 
192 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  56.22 
 
 
201 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  56.15 
 
 
189 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1630  peptidyl-tRNA hydrolase  49.17 
 
 
251 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.144518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  51.12 
 
 
243 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2768  peptidyl-tRNA hydrolase  53.2 
 
 
243 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3032  peptidyl-tRNA hydrolase  57.3 
 
 
243 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  51.66 
 
 
248 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3190  peptidyl-tRNA hydrolase  49.33 
 
 
234 aa  205  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29139  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  53.51 
 
 
202 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0666  peptidyl-tRNA hydrolase  52.68 
 
 
208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0756  peptidyl-tRNA hydrolase  47.74 
 
 
220 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.348899 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  40.66 
 
 
188 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  40.66 
 
 
188 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  44.07 
 
 
193 aa  145  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.07 
 
 
186 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  44.63 
 
 
193 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  46.98 
 
 
190 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  40.88 
 
 
230 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  47.98 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  40.74 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  43.29 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  43.33 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  51.32 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58488  normal  0.821965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.05 
 
 
207 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  47.98 
 
 
188 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 
192 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  42.54 
 
 
207 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  44.94 
 
 
192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  42.54 
 
 
213 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  41.11 
 
 
204 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.21 
 
 
207 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.05 
 
 
186 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  42.21 
 
 
210 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.21 
 
 
207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  41.44 
 
 
216 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
210 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.21 
 
 
207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.21 
 
 
207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.21 
 
 
186 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.21 
 
 
186 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.21 
 
 
186 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.21 
 
 
186 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
182 aa  136  3.0000000000000003e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  39.2 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  47.74 
 
 
213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 
188 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  44.12 
 
 
195 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  49.1 
 
 
191 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  37.21 
 
 
191 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  47.47 
 
 
213 aa  134  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.81 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  49.4 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.03 
 
 
193 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.98 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  43.92 
 
 
192 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  41.56 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  47.8 
 
 
192 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  40.24 
 
 
184 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 
191 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  47.44 
 
 
194 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.24 
 
 
193 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  38.07 
 
 
189 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  41.46 
 
 
196 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  36.48 
 
 
365 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
188 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4503  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  32.6 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>