More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0666 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0666  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  54.93 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0756  peptidyl-tRNA hydrolase  59.69 
 
 		 220 aa  224  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.348899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  54 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  55.32 
 
 		 205 aa  221  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  50.24 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  54.55 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  54.55 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  51.6 
 
 		 198 aa  211  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  54.36 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 		 210 aa  201  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 202 aa  198  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  48.77 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  56.21 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  50.72 
 
 		 243 aa  194  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  51.96 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 		 196 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  52.41 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  52.08 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  51.31 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  48.13 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  49.48 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  49.46 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  47.59 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3592  peptidyl-tRNA hydrolase  51.69 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  48.13 
 
 		 191 aa  178  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2768  peptidyl-tRNA hydrolase  47 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1630  peptidyl-tRNA hydrolase  46.63 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.144518  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1485  peptidyl-tRNA hydrolase  45.31 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1536  peptidyl-tRNA hydrolase  45.31 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0717803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  44.98 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3032  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3190  peptidyl-tRNA hydrolase  44 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29139  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  37.78 
 
 		 188 aa  140  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  37.22 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  42.77 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  41.9 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.44 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  41.58 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  46.86 
 
 		 191 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 213 aa  134  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.43 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  39.43 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  44 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.51 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  41.11 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2846  peptidyl-tRNA hydrolase  46.86 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050583  hitchhiker  0.00000000000287655 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  38.22 
 
 		 193 aa  131  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  46.36 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  33.7 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  40.66 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  38.98 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  38.98 
 
 		 185 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  41.86 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  39.39 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  37.24 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  33.7 
 
 		 365 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  40.66 
 
 		 192 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000106612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  37.85 
 
 		 186 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  45.71 
 
 		 193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  33.88 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  40.23 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  36.46 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.37 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 192 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  44.94 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  36.31 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  38.33 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4503  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.37 
 
 		 186 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.37 
 
 		 186 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.38 
 
 		 190 aa  125  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.37 
 
 		 186 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 		 191 aa  124  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  38.67 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>