More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2846 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2846  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050583  hitchhiker  0.00000000000287655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  76.44 
 
 		 191 aa  286  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  75.92 
 
 		 193 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  65.96 
 
 		 188 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  65.43 
 
 		 188 aa  247  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  59.16 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  54.45 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  44.79 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 		 195 aa  168  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  47.65 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  45.65 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 		 184 aa  164  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 188 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  46.99 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  52.44 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  44.97 
 
 		 191 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  48.26 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  46.33 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  46.82 
 
 		 225 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 225 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  154  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  46.82 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  45.05 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  45.05 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  45.05 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  46.74 
 
 		 189 aa  151  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 191 aa  151  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  49.42 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  39.8 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  45.18 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  46.78 
 
 		 191 aa  147  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 		 230 aa  147  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 193 aa  147  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.03 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  42.59 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  42.59 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.18 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  40.88 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  44.77 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  46.43 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  43.6 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  43.6 
 
 		 204 aa  144  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  41.58 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  48.3 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  40.89 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  47.1 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  43.45 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  41.36 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  46.26 
 
 		 232 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  41.99 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  41.86 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  44.64 
 
 		 202 aa  141  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  45.98 
 
 		 181 aa  141  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>