More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0745 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 193 aa  393  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  70.31 
 
 		 193 aa  258  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  64.4 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  60.64 
 
 		 188 aa  226  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  60.64 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  61.78 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2846  peptidyl-tRNA hydrolase  59.16 
 
 		 194 aa  214  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050583  hitchhiker  0.00000000000287655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  46.7 
 
 		 193 aa  157  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  46.74 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 202 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 202 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 188 aa  154  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  41.48 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.15 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  44.74 
 
 		 191 aa  151  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 191 aa  150  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  43.3 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 207 aa  148  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 193 aa  148  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 206 aa  147  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 210 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 181 aa  147  8e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  44.21 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.44 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  42.54 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 186 aa  144  8.000000000000001e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  39.8 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  39.77 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1024  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.421531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1454  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.21 
 
 		 229 aa  141  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00118085  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 		 213 aa  141  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 209 aa  141  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0466  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.916816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  42.41 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 		 180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  45.35 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  46.02 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  46.11 
 
 		 210 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  45.35 
 
 		 225 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  36.7 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  35.94 
 
 		 365 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  36.92 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  39.09 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  37.77 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>