More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1024 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1024  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 188 aa  389  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.421531  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1128  peptidyl-tRNA hydrolase  71.66 
 
 		 225 aa  271  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04025  peptidyl-tRNA hydrolase  65.96 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  53.76 
 
 		 188 aa  220  9e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1535  peptidyl-tRNA hydrolase  54.35 
 
 		 193 aa  218  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.838775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  54.35 
 
 		 186 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  52.17 
 
 		 186 aa  205  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0584  peptidyl-tRNA hydrolase  55.43 
 
 		 186 aa  204  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.691256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0166  peptidyl-tRNA hydrolase  54.35 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  47.83 
 
 		 191 aa  184  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 		 188 aa  154  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  45.65 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 217 aa  147  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 186 aa  144  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 209 aa  141  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.31 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.07 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  36.92 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  37.23 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.9 
 
 		 206 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  35.33 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  38.2 
 
 		 189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  36.9 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 		 199 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  42.76 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  38.24 
 
 		 191 aa  124  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  40.57 
 
 		 211 aa  124  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  35.29 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  41.38 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  39.33 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  40.57 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02831  peptidyl-tRNA hydrolase  40.46 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.396706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  34.76 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  40.68 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  35.14 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  38.69 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 		 190 aa  121  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 		 190 aa  121  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  36.6 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1653  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00866088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  35.9 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0398  peptidyl-tRNA hydrolase  40.48 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  37.17 
 
 		 202 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  38.32 
 
 		 207 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 		 180 aa  117  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  41.52 
 
 		 181 aa  117  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>