More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0357 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
181 aa  358  3e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  99.45 
 
 
181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1653  peptidyl-tRNA hydrolase  98.34 
 
 
181 aa  352  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00866088  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  70.56 
 
 
179 aa  251  3e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  65.93 
 
 
181 aa  234  7e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  62.78 
 
 
181 aa  228  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1303  peptidyl-tRNA hydrolase  62.09 
 
 
220 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1586  lipoprotein  56.69 
 
 
159 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0212  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 
191 aa  156  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.145584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  45.71 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0466  peptidyl-tRNA hydrolase  48.9 
 
 
184 aa  145  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.916816  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.24 
 
 
202 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  47.24 
 
 
202 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 
365 aa  144  6e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 
213 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  45.71 
 
 
188 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
189 aa  142  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.81 
 
 
210 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  46.41 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
190 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 
182 aa  137  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
239 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  40.82 
 
 
191 aa  136  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 
186 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  42.2 
 
 
208 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  44.07 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
186 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
195 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
210 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
186 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
186 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
186 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
207 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  43.45 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  44.97 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02831  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 
199 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.396706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
187 aa  131  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  43.2 
 
 
219 aa  131  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 
181 aa  131  6e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  44.07 
 
 
198 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
201 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  41.14 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  43.45 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.44 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  41.14 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
190 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
202 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 
186 aa  127  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  40.34 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 
186 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  42.21 
 
 
186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  44.07 
 
 
200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  46.75 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  40.78 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  40.94 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 
186 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  39.77 
 
 
202 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
210 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
210 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  39.53 
 
 
216 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  42.51 
 
 
205 aa  124  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  42.01 
 
 
201 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
190 aa  124  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  41.04 
 
 
193 aa  124  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 
205 aa  123  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 
200 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 
207 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.94 
 
 
193 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  42.07 
 
 
192 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
199 aa  123  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.79 
 
 
191 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 
185 aa  123  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  43.87 
 
 
203 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  43.87 
 
 
203 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  43.11 
 
 
186 aa  122  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  41.82 
 
 
193 aa  122  3e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  40.12 
 
 
206 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 
206 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.92 
 
 
199 aa  122  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 
186 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  43.56 
 
 
207 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  43.71 
 
 
188 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  39.08 
 
 
193 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 
189 aa  122  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  37.08 
 
 
192 aa  121  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  39.08 
 
 
192 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>