More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0071 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  53.23 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  48.63 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  47.62 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  47.09 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  47.59 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  47.87 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  47.85 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.9 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  51.09 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  51.09 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 		 217 aa  166  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.99 
 
 		 202 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  45.99 
 
 		 202 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.67 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  48.68 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 189 aa  161  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 210 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  48.13 
 
 		 214 aa  160  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 219 aa  160  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.81 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  48.13 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 186 aa  158  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  44.21 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2846  peptidyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050583  hitchhiker  0.00000000000287655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  46.56 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 190 aa  151  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 199 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  43.08 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 		 190 aa  147  8e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0079  peptidyl-tRNA hydrolase  51.09 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.110658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  47.57 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0968  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 188 aa  141  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  40.74 
 
 		 186 aa  141  7e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  48.28 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  47.53 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>