More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0745 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  56.76 
 
 
186 aa  229  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0584  peptidyl-tRNA hydrolase  57.3 
 
 
186 aa  219  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.691256  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  55.68 
 
 
188 aa  216  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1535  peptidyl-tRNA hydrolase  51.61 
 
 
193 aa  213  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.838775  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  53.51 
 
 
186 aa  209  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04025  peptidyl-tRNA hydrolase  49.19 
 
 
219 aa  201  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1128  peptidyl-tRNA hydrolase  50.81 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0166  peptidyl-tRNA hydrolase  51.89 
 
 
185 aa  195  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1024  peptidyl-tRNA hydrolase  47.83 
 
 
188 aa  184  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.421531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 
194 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 
184 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
189 aa  137  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
183 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 
186 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
190 aa  134  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 
207 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
207 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
196 aa  134  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  35.64 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
210 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
185 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 
189 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 
210 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
214 aa  130  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 
209 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  36.17 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.07 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  35.33 
 
 
228 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  41.42 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  36.17 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  41.42 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  36.76 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.76 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  37.17 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.11 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 
190 aa  124  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.23 
 
 
206 aa  123  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  38.75 
 
 
189 aa  123  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  36.07 
 
 
192 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0663  peptidyl-tRNA hydrolase  36.02 
 
 
195 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118368  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 
191 aa  122  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  35.42 
 
 
201 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
207 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  36.88 
 
 
188 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  36.51 
 
 
191 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  36.9 
 
 
201 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  34.59 
 
 
196 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  37.56 
 
 
201 aa  121  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  38.22 
 
 
213 aa  121  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  36.17 
 
 
188 aa  121  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  35.45 
 
 
189 aa  120  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
190 aa  120  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  32.78 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  38.02 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  36.17 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  37.79 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  35.45 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  37.93 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  36.88 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  35.48 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0398  peptidyl-tRNA hydrolase  40.23 
 
 
188 aa  119  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  36.18 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  36.79 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  37.64 
 
 
202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  37.64 
 
 
202 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  34.74 
 
 
206 aa  118  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
207 aa  118  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  34.34 
 
 
201 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  36.07 
 
 
202 aa  117  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.65 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>