More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0584 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0584  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.691256  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  57.53 
 
 
186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1535  peptidyl-tRNA hydrolase  59.46 
 
 
193 aa  223  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.838775  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  55.14 
 
 
188 aa  222  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  57.53 
 
 
186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  57.3 
 
 
191 aa  219  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04025  peptidyl-tRNA hydrolase  54.89 
 
 
219 aa  206  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1128  peptidyl-tRNA hydrolase  54.89 
 
 
225 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1024  peptidyl-tRNA hydrolase  55.43 
 
 
188 aa  204  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.421531  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0166  peptidyl-tRNA hydrolase  53.51 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 
194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  46.28 
 
 
209 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
207 aa  140  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
186 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 
210 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
184 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 
180 aa  136  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 
195 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 
213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 
186 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 
214 aa  131  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 
191 aa  129  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
186 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  43.04 
 
 
206 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 
213 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
187 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  39.15 
 
 
189 aa  124  7e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.78 
 
 
206 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
190 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 
205 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  35.87 
 
 
186 aa  122  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2846  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 
194 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050583  hitchhiker  0.00000000000287655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  35.68 
 
 
202 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  35.68 
 
 
202 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  38.2 
 
 
213 aa  121  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  35.52 
 
 
192 aa  120  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0817  peptidyl-tRNA hydrolase  40.35 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00002095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.15 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  41.77 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  41.82 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  41.82 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  34.43 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0398  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  35.68 
 
 
199 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  37.23 
 
 
196 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 
192 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 
192 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  36.9 
 
 
201 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 
192 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.14 
 
 
191 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  39.39 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  41.82 
 
 
210 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 
191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
190 aa  117  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  35.9 
 
 
219 aa  117  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 
181 aa  117  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  36.21 
 
 
189 aa  117  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  34.43 
 
 
188 aa  117  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 
181 aa  117  9e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 
181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>