More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30140 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  72.2 
 
 		 206 aa  263  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  66.84 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  69.54 
 
 		 198 aa  258  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  69.04 
 
 		 194 aa  257  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  69.35 
 
 		 196 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  63.54 
 
 		 201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  63.35 
 
 		 209 aa  251  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  63.08 
 
 		 197 aa  251  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  72.5 
 
 		 202 aa  247  8e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  62.76 
 
 		 189 aa  243  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  58.46 
 
 		 198 aa  237  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  59.49 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  60.82 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  61.83 
 
 		 213 aa  232  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  62.12 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  63.5 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  58.59 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  61.11 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  62.94 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  58.85 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  62.24 
 
 		 191 aa  214  5e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  63.13 
 
 		 196 aa  214  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  60.2 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  55.05 
 
 		 196 aa  210  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  61.54 
 
 		 195 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  53.93 
 
 		 192 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  53.93 
 
 		 192 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  53.93 
 
 		 192 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  57.79 
 
 		 194 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  60.41 
 
 		 204 aa  188  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  52.11 
 
 		 192 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  46.63 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  53.12 
 
 		 191 aa  175  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  53.12 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  46.84 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  42 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.59 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  45.74 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  40.45 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  41.12 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.82 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  41.97 
 
 		 232 aa  147  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  45.81 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  44.69 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  45.83 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  44.5 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 191 aa  141  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  40.4 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  38.69 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  43.81 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  44.04 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  43.82 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  42.64 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 213 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  43.5 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  36.73 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  45.24 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  40.78 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  39.79 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  44.63 
 
 		 192 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 194 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>