More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3951 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  74.23 
 
 		 195 aa  303  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  71.35 
 
 		 201 aa  272  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  65.99 
 
 		 198 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  64.67 
 
 		 209 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  63.83 
 
 		 189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  70.27 
 
 		 206 aa  246  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  64.17 
 
 		 196 aa  242  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  64.8 
 
 		 213 aa  241  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  58.33 
 
 		 213 aa  236  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  62.89 
 
 		 195 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  63.08 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  64.13 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  60.96 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  60.96 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  60.96 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  60.43 
 
 		 192 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  58.12 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  63.68 
 
 		 195 aa  220  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  59.36 
 
 		 194 aa  220  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  60.22 
 
 		 196 aa  219  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  59.9 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  61.38 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  62.24 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  63.59 
 
 		 221 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  59.38 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  60.32 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  54.77 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  56.68 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  59.2 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  62.3 
 
 		 194 aa  204  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  60.2 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  58.29 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  60.11 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  48.13 
 
 		 188 aa  187  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  57.3 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  55.73 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 187 aa  161  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  47.83 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 		 192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  41.48 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  47.83 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 		 188 aa  151  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  45.61 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 196 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  46.74 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  46.55 
 
 		 192 aa  147  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  44.04 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  40.66 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  34.25 
 
 		 189 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 		 184 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  45.65 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  45.61 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  45.65 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  38.55 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  45.3 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2846  peptidyl-tRNA hydrolase  46.99 
 
 		 194 aa  141  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050583  hitchhiker  0.00000000000287655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  45.3 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 201 aa  140  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>