More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1560 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 201 aa  417  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  69.15 
 
 		 202 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  61.11 
 
 		 201 aa  254  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1454  Aminoacyl-tRNA hydrolase  51.6 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00118085  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  45.64 
 
 		 192 aa  160  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0663  peptidyl-tRNA hydrolase  43.65 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118368  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  43.23 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 185 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  44.2 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  43.18 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  43.18 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  44.15 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  44.77 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000106612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  40.33 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  40.57 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 232 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.37 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  39.44 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  39.59 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  39.59 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  39.59 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.6 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.6 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.44 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.6 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.44 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.2 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 191 aa  141  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  44.58 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.44 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 188 aa  141  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 207 aa  140  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 207 aa  140  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 197 aa  140  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  45.29 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  43.5 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  38.66 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2344  peptidyl-tRNA hydrolase  43.88 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  44.25 
 
 		 193 aa  138  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.3 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01179  peptidyl-tRNA hydrolase  44.9 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2443  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.9 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0491513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  42.69 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1309  peptidyl-tRNA hydrolase  44.9 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  41.38 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  44.9 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  normal  0.097849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1351  peptidyl-tRNA hydrolase  44.9 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2422  peptidyl-tRNA hydrolase  44.9 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0426078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1685  peptidyl-tRNA hydrolase  44.9 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  0.435145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01189  hypothetical protein  44.9 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  39.66 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 		 209 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  42.41 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  39.66 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  42.37 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  39.59 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1916  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.295058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1354  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00856454  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  35.29 
 
 		 365 aa  136  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  37.06 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1922  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  37.86 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  40.88 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  36.59 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1980  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0660178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  39.09 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 		 181 aa  135  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  43.79 
 
 		 198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1538  peptidyl-tRNA hydrolase  44.9 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.415259  normal  0.044149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  34.04 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  36.55 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  39.6 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>