More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1454 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1454  Aminoacyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00118085  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  54.79 
 
 
202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  51.6 
 
 
201 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 
201 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  43.23 
 
 
198 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  42.46 
 
 
194 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 
232 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 
204 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 
211 aa  141  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  41.92 
 
 
211 aa  141  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  41.97 
 
 
225 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 
196 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
189 aa  137  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  39.68 
 
 
189 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 
183 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  46.34 
 
 
230 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 
185 aa  136  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  38.32 
 
 
214 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000106612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  44.77 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
192 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
207 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  38.37 
 
 
186 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.08 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  43.65 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  40.74 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
201 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  46.28 
 
 
193 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  43.43 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  38.66 
 
 
198 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
213 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  38.65 
 
 
186 aa  131  6.999999999999999e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  35.38 
 
 
189 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.8 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  43.1 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  41.95 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 
194 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 
188 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  39.35 
 
 
186 aa  128  6e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 
213 aa  128  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
207 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
186 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
207 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 
192 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 
192 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 
192 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.55 
 
 
186 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.55 
 
 
186 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.55 
 
 
186 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  43.23 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  41.32 
 
 
181 aa  126  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  36.92 
 
 
185 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.15 
 
 
186 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3629  peptidyl-tRNA hydrolase  45.4 
 
 
226 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  39.8 
 
 
197 aa  124  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  36.46 
 
 
190 aa  123  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
213 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
191 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  37.21 
 
 
189 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  40.49 
 
 
225 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 
225 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 
225 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  32.37 
 
 
219 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 
192 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  44.21 
 
 
193 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0347  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
203 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
201 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
201 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  40.51 
 
 
188 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
191 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 
188 aa  121  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  34.25 
 
 
190 aa  121  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  34.25 
 
 
190 aa  121  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0389  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 
202 aa  121  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0179253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  33.68 
 
 
202 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  33.68 
 
 
202 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  38.97 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  43.08 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 
202 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 
196 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  39.88 
 
 
181 aa  119  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>