More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2593 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  70.31 
 
 		 193 aa  261  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  58.64 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  57.59 
 
 		 193 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  55.85 
 
 		 188 aa  201  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  55.32 
 
 		 188 aa  201  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2846  peptidyl-tRNA hydrolase  54.45 
 
 		 194 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050583  hitchhiker  0.00000000000287655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  48.09 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  47.34 
 
 		 202 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.34 
 
 		 202 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.84 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  48.89 
 
 		 192 aa  157  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  45.08 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 		 194 aa  153  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 219 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 		 187 aa  151  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 195 aa  151  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 		 206 aa  150  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  48.52 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  44.15 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  48.52 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1454  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.28 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00118085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  43.23 
 
 		 201 aa  147  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  41.34 
 
 		 205 aa  147  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  48.33 
 
 		 192 aa  147  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000106612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 		 191 aa  147  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  49.09 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 		 202 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 		 193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  52.23 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  47.34 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  47.51 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  48.37 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  43.52 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.22 
 
 		 193 aa  144  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 195 aa  144  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 		 186 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 192 aa  144  8.000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 196 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 239 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 		 209 aa  141  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  45.86 
 
 		 207 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.32 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 		 186 aa  141  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  49.34 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  39.01 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  43.58 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  47.56 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  39.79 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  46.25 
 
 		 181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  37.21 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  48.63 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  46.67 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  48.3 
 
 		 232 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  39.29 
 
 		 209 aa  138  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  46.36 
 
 		 211 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>