More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0489 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  69.15 
 
 
201 aa  304  6e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  62.63 
 
 
201 aa  249  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1454  Aminoacyl-tRNA hydrolase  53.57 
 
 
229 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00118085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 
206 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  47.18 
 
 
198 aa  154  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  44 
 
 
192 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  44.85 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
209 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 
189 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 
232 aa  147  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.4 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  38.58 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  45.3 
 
 
225 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  37.06 
 
 
202 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.06 
 
 
202 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 
198 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 
197 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  39.2 
 
 
205 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 
191 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  47.62 
 
 
199 aa  143  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 
207 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  40.29 
 
 
196 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  37.78 
 
 
185 aa  142  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0663  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
195 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118368  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 
195 aa  141  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.2 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  41.97 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  38.33 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  38.33 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
201 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.58 
 
 
193 aa  137  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.69 
 
 
210 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  36.08 
 
 
186 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  42.56 
 
 
192 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  42.56 
 
 
192 aa  137  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000106612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
230 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  38.07 
 
 
192 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 
197 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  46.02 
 
 
213 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
216 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  40.7 
 
 
186 aa  136  2e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 
198 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  35.35 
 
 
200 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  49.06 
 
 
213 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  41.33 
 
 
195 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 
183 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  43.43 
 
 
213 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0643  peptidyl-tRNA hydrolase  44.13 
 
 
203 aa  135  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0101445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
207 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  37.13 
 
 
213 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  38.58 
 
 
188 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  35.75 
 
 
186 aa  135  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
196 aa  135  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  42.22 
 
 
196 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 
190 aa  134  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1354  peptidyl-tRNA hydrolase  46.23 
 
 
194 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00856454  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1922  peptidyl-tRNA hydrolase  46.23 
 
 
194 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1916  peptidyl-tRNA hydrolase  46.23 
 
 
194 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.295058  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 
186 aa  134  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  44.83 
 
 
185 aa  134  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.24 
 
 
207 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  38.55 
 
 
181 aa  134  9e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 
365 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  39.32 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.24 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.24 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.24 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1980  peptidyl-tRNA hydrolase  46.23 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0660178  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  40.99 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.24 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.24 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1303  peptidyl-tRNA hydrolase  38.62 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  48.72 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.24 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  39 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2344  peptidyl-tRNA hydrolase  46.23 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  41.36 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.24 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  38.02 
 
 
179 aa  132  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 
193 aa  132  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 
190 aa  132  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  34.72 
 
 
187 aa  132  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1538  peptidyl-tRNA hydrolase  45.73 
 
 
194 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.415259  normal  0.044149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.43 
 
 
186 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>