More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3091 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  60.85 
 
 
196 aa  238  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  54.05 
 
 
184 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0968  peptidyl-tRNA hydrolase  56.22 
 
 
195 aa  204  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 
191 aa  202  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  51.91 
 
 
188 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  51.37 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 
194 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.74 
 
 
186 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  49.46 
 
 
187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
188 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 
186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 
196 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.9 
 
 
186 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  45.9 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.9 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  45.9 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 
207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  45.65 
 
 
191 aa  171  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 
207 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.72 
 
 
183 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 
189 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  45.79 
 
 
208 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  46.7 
 
 
190 aa  167  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  46.7 
 
 
190 aa  167  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 
190 aa  167  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
210 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
185 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 
213 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 
228 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
202 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
202 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  48.09 
 
 
180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 
195 aa  159  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 
193 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
206 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  44.21 
 
 
209 aa  158  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 
213 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 
193 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
189 aa  154  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.69 
 
 
206 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 
195 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
189 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
201 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0079  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 
190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.110658  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
185 aa  151  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
200 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 
205 aa  151  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
186 aa  150  1e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 
185 aa  149  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
190 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
200 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 
192 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  40.53 
 
 
189 aa  148  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 
193 aa  147  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  42.27 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 
181 aa  145  3e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  48.08 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58488  normal  0.821965 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  40.66 
 
 
188 aa  144  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
190 aa  143  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 
191 aa  143  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 
189 aa  143  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  42.54 
 
 
186 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  37.91 
 
 
202 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  37.91 
 
 
213 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 
189 aa  142  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  38.67 
 
 
207 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
185 aa  142  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 
191 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
192 aa  141  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 
207 aa  140  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 
190 aa  140  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2846  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050583  hitchhiker  0.00000000000287655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  37.11 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  41.99 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 
190 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  40.56 
 
 
198 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
193 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 
188 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  38.5 
 
 
213 aa  138  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 
239 aa  138  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  39.01 
 
 
193 aa  137  7e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
202 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>