More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1220 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  84.38 
 
 		 196 aa  313  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  64.55 
 
 		 201 aa  263  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  65.59 
 
 		 209 aa  261  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  65.43 
 
 		 198 aa  260  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  69.04 
 
 		 202 aa  255  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  67.35 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  59.36 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  62.23 
 
 		 189 aa  237  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  58.29 
 
 		 195 aa  236  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  56.54 
 
 		 217 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  57.51 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  66.67 
 
 		 191 aa  228  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  70.2 
 
 		 202 aa  228  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  64.22 
 
 		 206 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  60 
 
 		 205 aa  224  6e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  59.56 
 
 		 213 aa  222  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  58.73 
 
 		 199 aa  219  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  58.38 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  63.16 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  60.94 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  62.57 
 
 		 195 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  58.85 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  52.13 
 
 		 196 aa  204  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  63.16 
 
 		 204 aa  204  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  57.95 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  60.32 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  51.04 
 
 		 192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  51.04 
 
 		 192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  51.04 
 
 		 192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  53.12 
 
 		 192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  51.83 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  57.59 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  55.96 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.64 
 
 		 199 aa  181  8.000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  48.96 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  42.56 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 214 aa  160  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.79 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  35.75 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  39.68 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 		 202 aa  141  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  43.92 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 179 aa  141  7e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  38.62 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.41 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  38.19 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  38.5 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  38.5 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  46.62 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.02 
 
 		 186 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  44.52 
 
 		 211 aa  137  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  44.52 
 
 		 211 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  44.59 
 
 		 207 aa  137  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  37.95 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  37.95 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  45.36 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>