More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3654 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.54 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  43.92 
 
 		 196 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.3 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  44.2 
 
 		 186 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 210 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  47.54 
 
 		 194 aa  165  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  45.74 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 188 aa  158  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0079  peptidyl-tRNA hydrolase  48.92 
 
 		 190 aa  154  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.110658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  42.65 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  40.82 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 		 191 aa  151  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.41 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.41 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 		 209 aa  147  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  39.8 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 188 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.82 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  36.82 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 		 190 aa  144  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  41.76 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  37.16 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 192 aa  141  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  41.81 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 180 aa  138  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  34.66 
 
 		 205 aa  137  7.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  40.68 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.76 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  40.66 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  40.68 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  40.12 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  39.56 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  38.16 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 190 aa  135  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 186 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0968  peptidyl-tRNA hydrolase  36.26 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.56 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  37.91 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  37.36 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  39.2 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  39.34 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  47.24 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>