More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1172 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 190 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  70.53 
 
 		 190 aa  297  7e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  71.28 
 
 		 190 aa  294  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  69.31 
 
 		 190 aa  286  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  66.32 
 
 		 189 aa  273  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  63.98 
 
 		 192 aa  259  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  60.22 
 
 		 217 aa  240  7.999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 		 196 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.05 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.59 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  44.27 
 
 		 202 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.27 
 
 		 202 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  44.04 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 188 aa  150  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 188 aa  150  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 190 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 190 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 		 190 aa  148  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 		 186 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 207 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 207 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 186 aa  147  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  41.36 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  39.79 
 
 		 217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  42.42 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.03 
 
 		 191 aa  144  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3160  peptidyl-tRNA hydrolase  44.74 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 195 aa  142  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  39.79 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 		 213 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 189 aa  137  7e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 		 205 aa  136  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.25 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  39.3 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0166  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1024  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.421531  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1535  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.838775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 205 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04025  peptidyl-tRNA hydrolase  40.74 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  37.82 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  38.59 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  40.91 
 
 		 213 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2286  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.22 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  35.6 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  35.87 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  36.32 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1128  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  37.99 
 
 		 213 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>