More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2286 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2286  aminoacyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 		 184 aa  147  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.56 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  41.58 
 
 		 209 aa  142  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 195 aa  138  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 		 188 aa  137  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  38.22 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  41.58 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.98 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  41.04 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  39.15 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  36.08 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  39.27 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  38.02 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  34.95 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 		 193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.62 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 190 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  39.3 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 		 192 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  38.22 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  35.48 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  33.87 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 		 207 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  36.51 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.51 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  38.61 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  35.94 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  43.04 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  38.25 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  38.74 
 
 		 192 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  34.9 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  34.57 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  35.11 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  35.98 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  39.7 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  35.36 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  36.92 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  35.64 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  35.58 
 
 		 365 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  36.73 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  36.9 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.81 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  34.39 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  35.45 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  32.8 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  35.98 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  35.64 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>