More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0466 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0466  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.916816  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  54.19 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0212  peptidyl-tRNA hydrolase  54.7 
 
 		 191 aa  176  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.145584  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1303  peptidyl-tRNA hydrolase  51.4 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  49.44 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  48.9 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  48.9 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1653  peptidyl-tRNA hydrolase  48.35 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00866088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.81 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  49.06 
 
 		 235 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.37 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  41.81 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 195 aa  154  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  47.67 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  47.67 
 
 		 210 aa  153  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.67 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  47.67 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  47.67 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  47.67 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.67 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  47.67 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1586  lipoprotein  48.1 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  47.09 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  46.15 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  46.15 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 365 aa  150  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  47.17 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  47.17 
 
 		 203 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 		 197 aa  147  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  43.79 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  43.89 
 
 		 202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  42.22 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.64 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 		 192 aa  144  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 213 aa  144  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 		 232 aa  144  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  40.78 
 
 		 180 aa  144  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  47.77 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  44.79 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  42.69 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  45.91 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  39.31 
 
 		 239 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 		 204 aa  141  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  43.71 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  42.54 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 213 aa  140  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  39.29 
 
 		 201 aa  140  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  44.07 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  44.65 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  44.75 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  42.53 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  43.6 
 
 		 202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 207 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  39.2 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  43.12 
 
 		 190 aa  137  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  41.99 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  46.62 
 
 		 182 aa  137  8.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.77 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 202 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  43.11 
 
 		 201 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  39.88 
 
 		 217 aa  136  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  39.53 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  41.04 
 
 		 214 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 		 199 aa  135  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  37.91 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.98 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  42.44 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 		 191 aa  134  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  37.78 
 
 		 216 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>