More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0307 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0307  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
194 aa  392  1e-108  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  47.37 
 
 
193 aa  167  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  44.23 
 
 
198 aa  159  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  43.86 
 
 
182 aa  153  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  43.53 
 
 
198 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 
191 aa  140  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 
189 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  41.21 
 
 
235 aa  137  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  39.29 
 
 
209 aa  137  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  43.56 
 
 
203 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 
193 aa  137  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  39.68 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 
202 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  39.77 
 
 
196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.25 
 
 
185 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  36.93 
 
 
188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  38.6 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  43.56 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  43.67 
 
 
213 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 
189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  44.37 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1303  peptidyl-tRNA hydrolase  41.99 
 
 
220 aa  131  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  37.17 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  40.23 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  38.61 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  37.82 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  40.12 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  42.04 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 
201 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 
207 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  42.14 
 
 
225 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  42.14 
 
 
225 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  43.33 
 
 
181 aa  127  8.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  37.91 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  40.12 
 
 
210 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.82 
 
 
199 aa  125  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  39.31 
 
 
206 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 
179 aa  124  6e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  39.53 
 
 
210 aa  124  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  39.53 
 
 
210 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.29 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 
181 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  43.87 
 
 
192 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  43.87 
 
 
192 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
235 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  43.87 
 
 
192 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 
181 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 
193 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  35.98 
 
 
201 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1653  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 
181 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00866088  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 
181 aa  123  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 
202 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  40.49 
 
 
205 aa  121  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  48.05 
 
 
239 aa  121  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58488  normal  0.821965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.29 
 
 
186 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  43.92 
 
 
194 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  37.14 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  35.6 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  46.1 
 
 
213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.11 
 
 
193 aa  118  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 
198 aa  118  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.81 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.25 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  37.27 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  43.94 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.38 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  38.36 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  42.34 
 
 
185 aa  115  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  38.27 
 
 
192 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  38.27 
 
 
207 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.88 
 
 
201 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  33.84 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  47.74 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  43.18 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
213 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.99 
 
 
186 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.99 
 
 
186 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  38.27 
 
 
207 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  38.99 
 
 
186 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  38.27 
 
 
207 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  38.27 
 
 
207 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  38.27 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.36 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  40.15 
 
 
211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  40.15 
 
 
211 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  38.93 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 
196 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
204 aa  111  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 
203 aa  111  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  32.98 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>