More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3206 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3206  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
428 aa  869    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
378 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154084  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  27.72 
 
 
550 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.57 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.33 
 
 
598 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  28.37 
 
 
621 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
586 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  26.84 
 
 
537 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
582 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0402  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.93747  normal  0.145713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  25 
 
 
608 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  25 
 
 
608 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  25 
 
 
608 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25 
 
 
608 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  25 
 
 
608 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  33.88 
 
 
506 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  26.59 
 
 
613 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 
595 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
526 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
733 aa  94  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
673 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
689 aa  92.8  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  24.71 
 
 
608 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
749 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0824  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25 
 
 
616 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125796 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
390 aa  90.5  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 
756 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 
845 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.25 
 
 
579 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 
1261 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  23.12 
 
 
604 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  30.77 
 
 
530 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
608 aa  89  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  23.74 
 
 
614 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.77 
 
 
530 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.18 
 
 
547 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
709 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  26.12 
 
 
600 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 
893 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.22 
 
 
1258 aa  86.7  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.86 
 
 
604 aa  86.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 
592 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
525 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
729 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  25 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  26.92 
 
 
581 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  28.82 
 
 
458 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.15 
 
 
1262 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
581 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  27.39 
 
 
458 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
525 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 
731 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  28.38 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
639 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 
970 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 
585 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  28.38 
 
 
458 aa  84  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.33 
 
 
655 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
756 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  28.89 
 
 
525 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 
708 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  28.38 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
816 aa  83.2  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  27.95 
 
 
465 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
1519 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
581 aa  83.2  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  27.73 
 
 
465 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 
671 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  23.92 
 
 
853 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  23.45 
 
 
611 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 
655 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 
589 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
1527 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  23.43 
 
 
622 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.6 
 
 
1255 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  28.38 
 
 
458 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.13 
 
 
785 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  23.09 
 
 
1255 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  27.73 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  26.62 
 
 
522 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  28.38 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  23.58 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
723 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2043  histidine kinase  27.63 
 
 
560 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
589 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
611 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
734 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  27.31 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  27.31 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.16 
 
 
895 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  27.48 
 
 
1230 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 
641 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.46 
 
 
901 aa  80.1  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1110  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230539  normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  27.31 
 
 
465 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
553 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>