More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0942 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0942  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5223  hypothetical protein  62.03 
 
 
336 aa  358  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3412  hypothetical protein  49.69 
 
 
318 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.35 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.14 
 
 
327 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  37.69 
 
 
327 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  42.71 
 
 
330 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  40.41 
 
 
331 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 
328 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  39.46 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  40.94 
 
 
318 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.85 
 
 
328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.46 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.51 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.25 
 
 
325 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.31 
 
 
328 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  38.46 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.31 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  40.6 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  39.25 
 
 
333 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.84 
 
 
332 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.89 
 
 
322 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.89 
 
 
326 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.44 
 
 
325 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0621  hypothetical protein  37.87 
 
 
357 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.44 
 
 
327 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.91 
 
 
339 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.97 
 
 
325 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39.19 
 
 
323 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  35.31 
 
 
321 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.91 
 
 
323 aa  208  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.63 
 
 
336 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  38.59 
 
 
322 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.38 
 
 
332 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  39.69 
 
 
326 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.14 
 
 
327 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  37.88 
 
 
332 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  39.93 
 
 
334 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.08 
 
 
345 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.08 
 
 
345 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0972  hypothetical protein  38.78 
 
 
323 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000140362  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  34.38 
 
 
327 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.09 
 
 
324 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.62 
 
 
321 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.37 
 
 
328 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.37 
 
 
328 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.58 
 
 
333 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  39.06 
 
 
395 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  38.91 
 
 
324 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.51 
 
 
332 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.45 
 
 
334 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  38.7 
 
 
344 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  41.06 
 
 
326 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  39.39 
 
 
326 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  39.86 
 
 
330 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  39.46 
 
 
335 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.53 
 
 
360 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  39.19 
 
 
349 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.07 
 
 
349 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38.31 
 
 
336 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.72 
 
 
328 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3991  hypothetical protein  38.78 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.95 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  37.99 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  36.95 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.7 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  35.38 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  36.59 
 
 
330 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.36 
 
 
335 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.8 
 
 
344 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  38.49 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  42.31 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  35.65 
 
 
337 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.07 
 
 
339 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  38.13 
 
 
328 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  35.69 
 
 
330 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  38.7 
 
 
324 aa  198  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  37.62 
 
 
333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  39.23 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.32 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.6 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  38.56 
 
 
344 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  36.73 
 
 
325 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  38.32 
 
 
321 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.14 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.8 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.07 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  40.71 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.47 
 
 
334 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  39.04 
 
 
325 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37.79 
 
 
339 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  35.85 
 
 
322 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  39.04 
 
 
325 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  40.48 
 
 
339 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.51 
 
 
327 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  37.54 
 
 
322 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  36.66 
 
 
321 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.04 
 
 
325 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.53 
 
 
337 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>