261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2541 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2492  hydrogen:quinone oxidoreductase  61.23 
 
 		 596 aa  764    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.44509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2625  cytochrome-c3 hydrogenase  65.97 
 
 		 600 aa  820    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.712826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08120  Ni,Fe-hydrogenase I large subunit  61.11 
 
 		 601 aa  754    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1942  hydrogen:quinone oxidoreductase  61.11 
 
 		 597 aa  745    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2143  hydrogen:quinone oxidoreductase  64.58 
 
 		 598 aa  805    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2541  Cytochrome-c3 hydrogenase  100 
 
 		 593 aa  1247    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal  0.411855 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2189  hydrogen:quinone oxidoreductase  64.58 
 
 		 598 aa  805    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.269515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3814  Cytochrome-c3 hydrogenase  63.16 
 
 		 602 aa  796    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344269  normal  0.0147903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2130  hydrogen:quinone oxidoreductase  64.41 
 
 		 598 aa  803    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638664  normal  0.0209583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4594  Cytochrome-c3 hydrogenase  62.2 
 
 		 597 aa  776    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1578  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  35.09 
 
 		 638 aa  355  1e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0592  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  36.78 
 
 		 596 aa  348  2e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1298  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  34.42 
 
 		 638 aa  339  9e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0197  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  34.19 
 
 		 638 aa  336  5.999999999999999e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283036 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0407  nickel-dependent hydrogenase large subunit  33.6 
 
 		 638 aa  331  2e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.781594  normal  0.0807519 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0945  Ni Fe-hydrogenase I large subunit-like protein  25.9 
 
 		 745 aa  206  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1787  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.93 
 
 		 481 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.993845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2952  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.69 
 
 		 546 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1245  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.83 
 
 		 566 aa  189  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.11159 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1042  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.03 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.90765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2055  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.72 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2742  Hydrogen:quinone oxidoreductase  25.73 
 
 		 518 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000126046  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0270  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.2 
 
 		 567 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2138  periplasmic (NiFe) hydrogenase, large subunit, isozyme 1  27.15 
 
 		 568 aa  177  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0110  [Ni/Fe] hydrogenase, group 1, large subunit, putative  27.97 
 
 		 526 aa  174  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0873  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.28 
 
 		 569 aa  174  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0544  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.02 
 
 		 566 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2320  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.08 
 
 		 570 aa  173  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1969  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.35 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.668451  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0273  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.03 
 
 		 488 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328721 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_120  Ni/Fe hydrogenase, large subunit  27.67 
 
 		 526 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3404  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.35 
 
 		 573 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.37903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1231  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.4 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0258  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.94 
 
 		 526 aa  171  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2503  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.39 
 
 		 567 aa  170  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1678  hydrogenase large chain  23.7 
 
 		 567 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3147  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.45 
 
 		 570 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3331  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.09 
 
 		 566 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0266  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.37 
 
 		 566 aa  166  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.322067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1861  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.86 
 
 		 572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2098  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, large subunit  24.42 
 
 		 567 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0766  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.37 
 
 		 569 aa  163  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0122  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.7 
 
 		 564 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.254382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1940  hydrogen:quinone oxidoreductase  27.74 
 
 		 475 aa  163  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2032  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.73 
 
 		 567 aa  163  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0709763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3771  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.92 
 
 		 597 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292608  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2037  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.22 
 
 		 568 aa  161  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2028  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.57 
 
 		 595 aa  161  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1368  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.9 
 
 		 571 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1592  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.8 
 
 		 572 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.663154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1163  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.64 
 
 		 597 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.28682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1821  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.09 
 
 		 567 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.545248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2156  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.09 
 
 		 567 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.352792  normal  0.370314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1879  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.09 
 
 		 567 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0785  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.39 
 
 		 560 aa  160  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0165  nickel-iron hydrogenase, large subunit  25.04 
 
 		 597 aa  159  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0497936  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1447  hydrogenase large chain  25.66 
 
 		 572 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1276  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.7 
 
 		 554 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.438048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3907  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  23.92 
 
 		 578 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1248  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.04 
 
 		 488 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.210122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1764  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.59 
 
 		 568 aa  159  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00976  hydrogenase 1, large subunit  26.21 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.170036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2671  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.21 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00020942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2144  hydrogenase 1 large subunit  26.21 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.375749  normal  0.757738 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00983  hypothetical protein  26.21 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3520  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.65 
 
 		 567 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1946  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.04 
 
 		 560 aa  158  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1088  hydrogenase 1 large subunit  26.21 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000594285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1081  hydrogenase 1 large subunit  26.21 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.674487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1209  hydrogenase 1 large subunit  26.21 
 
 		 597 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2089  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.92 
 
 		 567 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2104  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.36 
 
 		 567 aa  157  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3971  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.33 
 
 		 570 aa  157  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.533836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0718  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.06 
 
 		 549 aa  157  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.338951 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2342  hydrogenase 1 large subunit  26.67 
 
 		 597 aa  157  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.514327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2915  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.07 
 
 		 571 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.289083 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0053  nickel-dependent hydrogenase large subunit  24.73 
 
 		 633 aa  156  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725575  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0973  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.05 
 
 		 572 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000120136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1974  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.68 
 
 		 618 aa  156  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1155  nickel-dependent hydrogenase large subunit  24.83 
 
 		 597 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0699  hydrogenase 2 large subunit  25.68 
 
 		 567 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0337  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  23.89 
 
 		 598 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0168031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3270  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.55 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0179  uptake hydrogenase large subunit  25.62 
 
 		 570 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02870  hydrogenase 2, large subunit  25.68 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0702  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.68 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02819  hypothetical protein  25.68 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3463  hydrogenase 2 large subunit  25.68 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4306  hydrogenase 2 large subunit  25.68 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.228665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3174  hydrogenase 2 large subunit  25.68 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3421  hydrogenase 2 large subunit  25.68 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3280  hydrogenase 2 large subunit  25.68 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3320  hydrogenase 2 large subunit  25 
 
 		 567 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1907  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.03 
 
 		 567 aa  153  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0147  nickel-dependent hydrogenase large subunit  24.59 
 
 		 559 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3329  hydrogenase 2 large subunit  24.96 
 
 		 567 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3988  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  24.01 
 
 		 598 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3394  hydrogenase 2 large subunit  24.96 
 
 		 567 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.571998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50580  Membrane bound nickel-dependent hydrogenase, large subunit, HoxG  25.04 
 
 		 602 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.980558  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3495  hydrogenase 2 large subunit  24.96 
 
 		 567 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.233634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>