277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2130 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4594  Cytochrome-c3 hydrogenase  71.03 
 
 
597 aa  890    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2625  cytochrome-c3 hydrogenase  72.91 
 
 
600 aa  934    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.712826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3814  Cytochrome-c3 hydrogenase  79.22 
 
 
602 aa  995    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344269  normal  0.0147903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2541  Cytochrome-c3 hydrogenase  64.41 
 
 
593 aa  789    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal  0.411855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1942  hydrogen:quinone oxidoreductase  68.97 
 
 
597 aa  864    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2130  hydrogen:quinone oxidoreductase  100 
 
 
598 aa  1259    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638664  normal  0.0209583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2143  hydrogen:quinone oxidoreductase  99.33 
 
 
598 aa  1252    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2492  hydrogen:quinone oxidoreductase  76.91 
 
 
596 aa  964    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.44509  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2189  hydrogen:quinone oxidoreductase  99.33 
 
 
598 aa  1252    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.269515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08120  Ni,Fe-hydrogenase I large subunit  71.85 
 
 
601 aa  899    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0592  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  37.02 
 
 
596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1578  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  32.57 
 
 
638 aa  306  7e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1298  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  32.85 
 
 
638 aa  300  7e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0197  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  31.61 
 
 
638 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0283036 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0407  nickel-dependent hydrogenase large subunit  31.45 
 
 
638 aa  287  4e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.781594  normal  0.0807519 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0945  Ni Fe-hydrogenase I large subunit-like protein  27.1 
 
 
745 aa  213  7.999999999999999e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1787  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.83 
 
 
481 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.993845  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1245  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.01 
 
 
566 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.11159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2028  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.22 
 
 
595 aa  187  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0544  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.39 
 
 
566 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2742  Hydrogen:quinone oxidoreductase  26.66 
 
 
518 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000126046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1969  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.57 
 
 
514 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.668451  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0110  [Ni/Fe] hydrogenase, group 1, large subunit, putative  29.17 
 
 
526 aa  180  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1163  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.95 
 
 
597 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.28682  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1861  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.45 
 
 
572 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0179  uptake hydrogenase large subunit  27.24 
 
 
570 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0973  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.94 
 
 
572 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000120136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0873  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.72 
 
 
569 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1447  hydrogenase large chain  28.71 
 
 
572 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333249  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2055  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.26 
 
 
566 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1231  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.35 
 
 
458 aa  177  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2320  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.29 
 
 
570 aa  177  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_120  Ni/Fe hydrogenase, large subunit  28.57 
 
 
526 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1940  hydrogen:quinone oxidoreductase  27.5 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3771  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.99 
 
 
597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292608  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2952  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.85 
 
 
546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0270  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.21 
 
 
567 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1678  hydrogenase large chain  28.15 
 
 
567 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0856  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.78 
 
 
572 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0258  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.31 
 
 
526 aa  173  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3375  hypothetical protein  26.56 
 
 
596 aa  173  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281049  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3988  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.72 
 
 
598 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2138  periplasmic (NiFe) hydrogenase, large subunit, isozyme 1  28.57 
 
 
568 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1592  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.87 
 
 
572 aa  171  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.663154  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1821  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.17 
 
 
567 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.545248  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2156  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.17 
 
 
567 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.352792  normal  0.370314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1879  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.17 
 
 
567 aa  171  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3147  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.71 
 
 
570 aa  170  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2089  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.15 
 
 
567 aa  170  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3098  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.84 
 
 
597 aa  170  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0165  nickel-iron hydrogenase, large subunit  27.02 
 
 
597 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0497936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3404  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.28 
 
 
573 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.37903  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1997  uptake hydrogenase large subunit precursor  27.46 
 
 
596 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2098  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, large subunit  27.66 
 
 
567 aa  169  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00976  hydrogenase 1, large subunit  27.27 
 
 
597 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.170036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2671  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.27 
 
 
597 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00020942  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1375  Ni-Fe hydrogenase large chain  26.38 
 
 
596 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0200361  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1088  hydrogenase 1 large subunit  27.27 
 
 
597 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000594285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00983  hypothetical protein  27.27 
 
 
597 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2104  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.08 
 
 
567 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1155  nickel-dependent hydrogenase large subunit  26.96 
 
 
597 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2144  hydrogenase 1 large subunit  27.27 
 
 
597 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.375749  normal  0.757738 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1081  hydrogenase 1 large subunit  27.27 
 
 
597 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.674487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1042  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.7 
 
 
485 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.90765  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2342  hydrogenase 1 large subunit  27.32 
 
 
597 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.514327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1209  hydrogenase 1 large subunit  27.27 
 
 
597 aa  167  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1347  hydrogenase 1 large subunit  26.95 
 
 
597 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0496  hydrogenase protein large subunit  25.6 
 
 
596 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1531  hydrogenase 1 large subunit  27.11 
 
 
597 aa  167  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.447937  normal  0.256595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1925  hydrogenase 1 large subunit  27.11 
 
 
597 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1929  hydrogenase 1 large subunit  27.11 
 
 
597 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2147  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.6 
 
 
596 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0605986  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1985  hydrogenase 1 large subunit  26.95 
 
 
597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0854  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.6 
 
 
572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.255543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0785  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.99 
 
 
560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2032  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.15 
 
 
567 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0709763  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0273  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.42 
 
 
488 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3331  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.27 
 
 
566 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1888  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.22 
 
 
567 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.261784  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1921  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.38 
 
 
567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2405  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.38 
 
 
567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.286384  hitchhiker  0.000502851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1633  [Ni/Fe] hydrogenase, large subunit  26.76 
 
 
600 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1709  [Ni/Fe] hydrogenase large subunit  26.76 
 
 
600 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1798  [Ni/Fe] hydrogenase, large subunit  26.76 
 
 
600 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.570579  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1162  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.77 
 
 
596 aa  163  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122791  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3907  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.69 
 
 
578 aa  163  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1650  [Ni/Fe] hydrogenase large subunit  26.76 
 
 
600 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1642  [Ni/Fe] hydrogenase, large subunit  26.76 
 
 
600 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.251142  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1764  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.95 
 
 
568 aa  163  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3520  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.86 
 
 
567 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1914  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.22 
 
 
567 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1266  Ni-Fe hydrogenase large chain  26.27 
 
 
583 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3286  [Ni/Fe] hydrogenase, large subunit  25.24 
 
 
585 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2884  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.24 
 
 
585 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.308731  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1248  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.45 
 
 
488 aa  160  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.210122 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2037  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.32 
 
 
568 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12910  Ni,Fe-hydrogenase I large subunit  26.97 
 
 
545 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.343906  normal  0.388227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3368  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.99 
 
 
570 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1946  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.66 
 
 
560 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50580  Membrane bound nickel-dependent hydrogenase, large subunit, HoxG  25.04 
 
 
602 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.980558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>