More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3330 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
275 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115875  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
237 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
239 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
250 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
250 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
234 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
254 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
248 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.48 
 
 
226 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 
237 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
246 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
222 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
246 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.893367  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
246 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
246 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.19 
 
 
231 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
246 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
281 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 
254 aa  85.5  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 
236 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  32.07 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.76 
 
 
226 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.184809  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
248 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0749847  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
247 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
227 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.0656338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.805502  normal  0.135775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.41753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0158219  normal  0.051875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  33.91 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314701  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.51 
 
 
249 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.42 
 
 
247 aa  79  0.00000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
244 aa  79  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  24.66 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.77 
 
 
253 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
252 aa  79  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0065631  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  25.64 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1734  short chain dehydrogenase  30.34 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747593  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.58 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  30.08 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1515  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303752  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.39 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.39 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>