More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1032 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
234 aa  482  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00144491  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
233 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.32 
 
 
232 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 
232 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  34.32 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
228 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
232 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
228 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
231 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 
229 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  31.09 
 
 
234 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 
233 aa  99  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
227 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  30.21 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3423  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.39 
 
 
234 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3450  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.81 
 
 
234 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  32.2 
 
 
229 aa  95.1  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 
231 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3196  short chain dehydrogenase  30.52 
 
 
234 aa  95.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3437  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.52 
 
 
234 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3218  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.05 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.2 
 
 
240 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3471  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.05 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  27.47 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  27.47 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  27.47 
 
 
226 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.506179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  31.49 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1457  hypothetical protein  32.92 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  30.67 
 
 
257 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
227 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
223 aa  87  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  29.02 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
239 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  29.02 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11130  short chain dehydrogenase  28.39 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  31.31 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1526  hypothetical protein  31.8 
 
 
213 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0902023 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 
250 aa  85.1  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  28 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  28 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  28.33 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  27.72 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  31.61 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.562749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  33.92 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.66 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  31.66 
 
 
304 aa  82  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 
221 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
237 aa  82  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  25.78 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  30.46 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1284  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  27.18 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.183563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  30.57 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  27 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  28.27 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.96 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12179  normal  0.661706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>