More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0404 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
236 aa  461  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.573614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.75 
 
 
242 aa  274  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.744613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2164  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
239 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.56 
 
 
241 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.527172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
236 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.400041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
240 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.956493  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
223 aa  95.5  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0806926  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20330  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.36 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389925  normal  0.158335 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03293  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00545103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0937479  normal  0.693303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100527  hitchhiker  0.00000000000000573842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.53 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.39 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02694  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G14000)  28.45 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 
274 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.325516  hitchhiker  0.000000000000965184 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6063  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10875  short chain dehydrogenase/reductase (Ayr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04530)  26.34 
 
 
297 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.47 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.78 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
267 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 
269 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.51 
 
 
317 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.21 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
265 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.96 
 
 
339 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.69 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0912876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
246 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
267 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
267 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.73 
 
 
268 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6052  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.48 
 
 
244 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110774  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.19 
 
 
246 aa  62  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.495414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
248 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
351 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
271 aa  62  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  25.57 
 
 
321 aa  61.6  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4758  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
229 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000972291  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.87 
 
 
245 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1429  putative short chain dehydrogenase  25.96 
 
 
255 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0142778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
270 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.442455  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
270 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0110329  normal  0.0245266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.982216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.47 
 
 
340 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.47 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0147442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.29 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155625 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.83 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09127  short-chain oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13950)  28.96 
 
 
294 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.14 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
354 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.947162  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.01 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
263 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10780  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 
275 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 
276 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.26 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
355 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0192  putative short chain dehydrogenase  27.35 
 
 
242 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 
340 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.79 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
266 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.78 
 
 
272 aa  58.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.95 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.4 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  28.73 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01430  putative short chain dehydrogenase  27.35 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25360  short-chain dehydrogenase/reductase acting with NAD or NADP as acceptor  28.49 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.421024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  32.33 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  28.66 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  26.67 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.57 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0125  putative short-chain dehydrogenase  27.4 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>