More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0125 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0125  putative short-chain dehydrogenase  100 
 
 
251 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1429  putative short chain dehydrogenase  85.6 
 
 
255 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0142778 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1240  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  65.85 
 
 
258 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2436  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  65.85 
 
 
292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1166  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  65.85 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932986  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0714  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  65.45 
 
 
258 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0749  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  65.45 
 
 
258 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.66118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1712  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  65.45 
 
 
258 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.595621  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1562  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  65.45 
 
 
278 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0908  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.44 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700496  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.85 
 
 
242 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.73156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.45 
 
 
246 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.53 
 
 
246 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
242 aa  214  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6063  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
244 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.44 
 
 
270 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 
298 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18326  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.3 
 
 
246 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6052  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.64 
 
 
244 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0192  putative short chain dehydrogenase  45.06 
 
 
242 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01430  putative short chain dehydrogenase  45.49 
 
 
242 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100527  hitchhiker  0.00000000000000573842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.21 
 
 
243 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.78 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.997812  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 
243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
245 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 
243 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.477245  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2881  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.92 
 
 
243 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.959841  normal  0.948307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3907  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
242 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180445  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
244 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0912876 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
251 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 
246 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.495414  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
245 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
245 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167282  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0314  putative acetoin(diacetyl) reductase  43.39 
 
 
245 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
247 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5150  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
245 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
248 aa  185  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
245 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02694  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G14000)  45.16 
 
 
243 aa  182  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 
236 aa  175  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
243 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
232 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.406883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7134  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.95 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
233 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  0.589272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 
231 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
233 aa  160  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
236 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
233 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.32958  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 
233 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 
233 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0675753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4758  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
229 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000972291  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
233 aa  145  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.286182  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03293  conserved hypothetical protein  33.47 
 
 
264 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00545103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0240  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
233 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377738  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
233 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.325516  hitchhiker  0.000000000000965184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
234 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.623849  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20677  predicted protein  37.77 
 
 
236 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
219 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
255 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  40.29 
 
 
258 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
249 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
254 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
223 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0806926  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  32.14 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  38.16 
 
 
255 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  28.34 
 
 
270 aa  99  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 
254 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
233 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  30.36 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  31.55 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  33.05 
 
 
255 aa  92.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  31.55 
 
 
261 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  31.02 
 
 
261 aa  91.7  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  31.55 
 
 
261 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  31.55 
 
 
261 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  29.76 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  31.55 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  30.48 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.07 
 
 
238 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  32.91 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  31.02 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  28.73 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  30.48 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.61 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
244 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>