More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6063 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6063  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
244 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6052  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.92 
 
 
244 aa  390  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3907  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.51 
 
 
242 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180445  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.59 
 
 
270 aa  384  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.32 
 
 
246 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.495414  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.25 
 
 
246 aa  384  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2881  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  76.76 
 
 
243 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.959841  normal  0.948307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.35 
 
 
243 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.477245  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.31 
 
 
242 aa  367  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.79 
 
 
243 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.997812  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.27 
 
 
243 aa  364  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.55 
 
 
243 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.25 
 
 
298 aa  359  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18326  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.08 
 
 
242 aa  337  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100527  hitchhiker  0.00000000000000573842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0192  putative short chain dehydrogenase  62.81 
 
 
242 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01430  putative short chain dehydrogenase  62.81 
 
 
242 aa  323  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.75 
 
 
244 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0912876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.87 
 
 
243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5150  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 
245 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.05 
 
 
245 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
247 aa  244  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.9 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.05 
 
 
245 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.05 
 
 
245 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167282  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0314  putative acetoin(diacetyl) reductase  50.63 
 
 
245 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.58 
 
 
248 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.23 
 
 
236 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0125  putative short-chain dehydrogenase  44.34 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1429  putative short chain dehydrogenase  44.34 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0142778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.87 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0908  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.64 
 
 
246 aa  194  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700496  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
246 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1166  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.42 
 
 
253 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2436  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.42 
 
 
292 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
242 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.73156 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1240  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.42 
 
 
258 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0714  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39 
 
 
258 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0749  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39 
 
 
258 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.66118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1712  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39 
 
 
258 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.595621  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4758  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000972291  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7134  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.78 
 
 
233 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
236 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
246 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1562  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.83 
 
 
278 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
233 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
231 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03293  conserved hypothetical protein  33.2 
 
 
264 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00545103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0240  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
233 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377738  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.406883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
233 aa  158  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.286182  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02694  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G14000)  38.46 
 
 
243 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
233 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.32958  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
233 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.325516  hitchhiker  0.000000000000965184 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
233 aa  148  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  0.589272 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
233 aa  148  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.623849  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0675753 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
251 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20677  predicted protein  32.64 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
217 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0937479  normal  0.693303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
223 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0806926  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1794  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
238 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
219 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  28.4 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
239 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.25 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  30 
 
 
265 aa  93.6  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.43 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.91 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476786  normal  0.058074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.5 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.8 
 
 
260 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 
254 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00930  conserved hypothetical protein  26.98 
 
 
252 aa  89  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 
254 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386082  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.31 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.72 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  31.56 
 
 
255 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.01 
 
 
241 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>