More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4725 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
246 aa  507  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6063  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.25 
 
 
244 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6052  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.99 
 
 
244 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2881  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  81.74 
 
 
243 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.959841  normal  0.948307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.74 
 
 
243 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.16 
 
 
243 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.997812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.33 
 
 
243 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.477245  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.86 
 
 
246 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.495414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3907  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.84 
 
 
242 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180445  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.25 
 
 
243 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.41 
 
 
270 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.61 
 
 
242 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.31 
 
 
242 aa  359  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100527  hitchhiker  0.00000000000000573842 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.75 
 
 
298 aa  352  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18326  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01430  putative short chain dehydrogenase  66.11 
 
 
242 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0192  putative short chain dehydrogenase  65.69 
 
 
242 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.35 
 
 
244 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0912876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.32 
 
 
243 aa  266  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5150  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.84 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.74 
 
 
245 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
245 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 
245 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167282  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.88 
 
 
247 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.63 
 
 
245 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0314  putative acetoin(diacetyl) reductase  48.98 
 
 
245 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
248 aa  241  9e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.63 
 
 
236 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1429  putative short chain dehydrogenase  48.4 
 
 
255 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0142778 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0125  putative short-chain dehydrogenase  47.95 
 
 
251 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0908  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.89 
 
 
246 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700496  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 
246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1240  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 
258 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4758  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
229 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000972291  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1166  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.03 
 
 
253 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2436  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 
292 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0714  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.46 
 
 
258 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1712  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.46 
 
 
258 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.595621  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0749  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.46 
 
 
258 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.66118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
236 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
246 aa  178  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02694  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G14000)  40.89 
 
 
243 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
231 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1562  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.08 
 
 
278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
232 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.406883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7134  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.37 
 
 
233 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
242 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.73156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
233 aa  165  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.286182  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
233 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  0.589272 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
246 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03293  conserved hypothetical protein  32.95 
 
 
264 aa  159  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00545103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
233 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0675753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
233 aa  154  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.32958  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
233 aa  154  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.325516  hitchhiker  0.000000000000965184 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
233 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0240  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377738  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
234 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.623849  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
251 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20677  predicted protein  35.27 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
217 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0937479  normal  0.693303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
223 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0806926  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
249 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
219 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
251 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383425 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00930  conserved hypothetical protein  29.08 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476786  normal  0.058074 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.81 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1390  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.81 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1302  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.81 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1014  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.81 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3043  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.81 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.81 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  35 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3172  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.39 
 
 
251 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1794  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.85 
 
 
238 aa  93.2  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  35 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
259 aa  92  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
254 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.85 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1482  glucose 1-dehydrogenase  33.47 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.350696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.28 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
269 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
259 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  30.29 
 
 
253 aa  89  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
259 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 
254 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
259 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
283 aa  89  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
259 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
269 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
249 aa  88.6  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>