More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5693 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
232 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.406883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.21 
 
 
231 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.76 
 
 
233 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  0.589272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4758  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.11 
 
 
229 aa  275  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000972291  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7134  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  61.84 
 
 
233 aa  271  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.88 
 
 
233 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0675753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.32 
 
 
234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.623849  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.01 
 
 
233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.32958  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.17 
 
 
236 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.39 
 
 
233 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0240  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.58 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377738  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.88 
 
 
233 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.286182  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.57 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0192  putative short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01430  putative short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6063  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 
244 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
236 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0125  putative short-chain dehydrogenase  42.15 
 
 
251 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
244 aa  158  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0912876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
242 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100527  hitchhiker  0.00000000000000573842 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6052  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
244 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110774  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
298 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18326  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
270 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
245 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
243 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
246 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1429  putative short chain dehydrogenase  39.01 
 
 
255 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0142778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
242 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
246 aa  148  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
243 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5150  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.997812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.477245  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2881  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.99 
 
 
243 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.959841  normal  0.948307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3907  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
242 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180445  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0314  putative acetoin(diacetyl) reductase  35.1 
 
 
245 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
245 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167282  normal  0.978745 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02694  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G14000)  36.73 
 
 
243 aa  142  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
247 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
245 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0749  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.66118  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0714  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1712  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.595621  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2436  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 
292 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1240  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 
258 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1166  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 
253 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932986  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 
233 aa  138  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.325516  hitchhiker  0.000000000000965184 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0908  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.7 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700496  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.495414  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20677  predicted protein  37.5 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
242 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.73156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1562  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
278 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03293  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 
264 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00545103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
246 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
219 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00930  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 
252 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0806926  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899344  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0937479  normal  0.693303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.38 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
254 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.11 
 
 
238 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
257 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  0.0943454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
259 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  34.46 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.901767  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  29.87 
 
 
269 aa  85.1  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  29.78 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  29.94 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  31.4 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.27 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  29.67 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.9 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.43 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  30.48 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.45 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.22 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.45 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0764891  hitchhiker  0.00221105 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  29.94 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>