More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1429 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1429  putative short chain dehydrogenase  100 
 
 		 255 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0142778 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0125  putative short-chain dehydrogenase  85.6 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2436  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.14 
 
 		 292 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1240  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.14 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0714  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.75 
 
 		 258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1166  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.89 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0749  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.75 
 
 		 258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.66118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1712  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.75 
 
 		 258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.595621  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1562  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.75 
 
 		 278 aa  294  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0908  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.47 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.38 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.66 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.07 
 
 		 242 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.58 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.44 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6063  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0192  putative short chain dehydrogenase  43.78 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01430  putative short chain dehydrogenase  43.78 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.05 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100527  hitchhiker  0.00000000000000573842 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6052  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110774  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3907  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.92 
 
 		 242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 		 243 aa  191  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0912876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.495414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5150  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.997812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.477245  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2881  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.64 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.959841  normal  0.948307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0314  putative acetoin(diacetyl) reductase  40.5 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167282  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 247 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237685 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02694  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G14000)  41.7 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.406883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7134  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  0.589272 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.32958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4758  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000972291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.325516  hitchhiker  0.000000000000965184 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03293  conserved hypothetical protein  35.08 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00545103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.286182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0240  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20677  predicted protein  36.91 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.623849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  42.49 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0806926  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  38.72 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  37.27 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  31.31 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  31.31 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  37.28 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  31.31 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  30.84 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  31.31 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  31.78 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  30.66 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  31.31 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  30.84 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  30.36 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  29.28 
 
 		 269 aa  95.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  31.55 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  30.95 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.82 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  31.46 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 257 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3195  amino acid adenylation domain-containing protein  30.57 
 
 		 2031 aa  92  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  30.05 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.21 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>