More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2193 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
233 aa  464  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
232 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.406883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.57 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  0.589272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.13 
 
 
233 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0675753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7134  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.89 
 
 
233 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
236 aa  185  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.7 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.32958  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4758  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
229 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000972291  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.286182  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.59 
 
 
236 aa  165  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
233 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.325516  hitchhiker  0.000000000000965184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
233 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 
231 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.89 
 
 
234 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.623849  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02694  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G14000)  38.66 
 
 
243 aa  159  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
242 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.73156 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03293  conserved hypothetical protein  34.96 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00545103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
242 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100527  hitchhiker  0.00000000000000573842 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20677  predicted protein  37.34 
 
 
236 aa  153  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0192  putative short chain dehydrogenase  36.13 
 
 
242 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
246 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0125  putative short-chain dehydrogenase  39.82 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0240  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
233 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377738  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6063  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
244 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1429  putative short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
255 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0142778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01430  putative short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
242 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
244 aa  148  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0912876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
270 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1240  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.93 
 
 
258 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0714  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.93 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1712  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.93 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.595621  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2436  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.93 
 
 
292 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1166  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.93 
 
 
253 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0749  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.93 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.66118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
243 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0908  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.84 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700496  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
243 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.997812  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6052  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
244 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1562  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.93 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.477245  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.495414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2881  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.45 
 
 
243 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.959841  normal  0.948307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
245 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 
243 aa  132  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
246 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
242 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5150  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
298 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18326  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167282  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
247 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3907  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
242 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180445  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
251 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0806926  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0314  putative acetoin(diacetyl) reductase  32.24 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
265 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
234 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
233 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
236 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.901767  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 
235 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0764891  hitchhiker  0.00221105 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 
238 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  37.5 
 
 
260 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
251 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
238 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.57 
 
 
246 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.94 
 
 
238 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  32.76 
 
 
253 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.227086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
253 aa  99  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  33.71 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.46 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35637  predicted protein  37.2 
 
 
635 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  26.94 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  34.64 
 
 
255 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0549  putative short-chain dehydrogenase/reductase, FabG-like  33.71 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204322  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
339 aa  95.9  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  30.35 
 
 
256 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.46 
 
 
241 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.38 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0734  putative short chain dehydrogenase  31.98 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.491859  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>