120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1141 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1141  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  939    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0847232  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1195  ribosomal protein L7/L12  34.08 
 
 		 860 aa  244  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.191109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  20.17 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  20.57 
 
 		 697 aa  67  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  21.21 
 
 		 706 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  28.28 
 
 		 713 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  28.28 
 
 		 704 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  24.63 
 
 		 702 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  28.47 
 
 		 732 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  28.47 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  28.47 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  24.14 
 
 		 633 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  24.14 
 
 		 633 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  24.14 
 
 		 633 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  24.43 
 
 		 633 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  24.43 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  25.57 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  25.57 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  25.57 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  27.01 
 
 		 741 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  27.01 
 
 		 741 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 783 aa  56.6  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  24.43 
 
 		 713 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  29.25 
 
 		 778 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 975 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  29.25 
 
 		 794 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  29.25 
 
 		 792 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  30.19 
 
 		 841 aa  53.5  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  21.71 
 
 		 748 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  21.71 
 
 		 763 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 		 841 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  21.71 
 
 		 748 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  21.71 
 
 		 748 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  21.71 
 
 		 763 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  21.71 
 
 		 763 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  21.71 
 
 		 748 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  25.2 
 
 		 763 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 		 841 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 		 838 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  29.13 
 
 		 641 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  20 
 
 		 858 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1893  Rhs element Vgr protein  25.2 
 
 		 762 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  20 
 
 		 930 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  20 
 
 		 896 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  30.63 
 
 		 782 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  30.63 
 
 		 782 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  32.14 
 
 		 642 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  20.06 
 
 		 1048 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  25.2 
 
 		 762 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  25.2 
 
 		 762 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  25.2 
 
 		 762 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  25.2 
 
 		 762 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  25.2 
 
 		 762 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  25.2 
 
 		 762 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  25.2 
 
 		 762 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 682 aa  50.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  21.95 
 
 		 886 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  25.71 
 
 		 690 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  20 
 
 		 872 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  24.77 
 
 		 846 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  25.51 
 
 		 901 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  22.9 
 
 		 694 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  28.74 
 
 		 767 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  20.11 
 
 		 845 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  20.59 
 
 		 730 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  26.81 
 
 		 1095 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  23.73 
 
 		 871 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  25.16 
 
 		 709 aa  47.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  23.73 
 
 		 875 aa  47.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  21.9 
 
 		 694 aa  47.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  21.9 
 
 		 655 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 869 aa  47.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  20.12 
 
 		 723 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  20.15 
 
 		 729 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  24.39 
 
 		 645 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  19.53 
 
 		 1057 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  26.53 
 
 		 837 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  20.15 
 
 		 743 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  26.53 
 
 		 918 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  22.51 
 
 		 729 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  21.18 
 
 		 958 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  20.48 
 
 		 706 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  27.54 
 
 		 694 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  26.53 
 
 		 885 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  20.96 
 
 		 687 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  20.96 
 
 		 687 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  20.96 
 
 		 687 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  29.41 
 
 		 699 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  31.33 
 
 		 691 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  22.79 
 
 		 725 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  17.17 
 
 		 692 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  29.55 
 
 		 787 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  22.57 
 
 		 714 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  23.71 
 
 		 840 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  24 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  26.15 
 
 		 618 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.51 
 
 		 920 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  24.55 
 
 		 952 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  27.06 
 
 		 767 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  26.37 
 
 		 730 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>