135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1218 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  100 
 
 
337 aa  666    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  52.96 
 
 
363 aa  352  5.9999999999999994e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0111  putative chemotaxis protein MotB  51.13 
 
 
366 aa  329  4e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.876361  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  47.28 
 
 
334 aa  295  6e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  38.07 
 
 
385 aa  248  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  43.03 
 
 
317 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  43.03 
 
 
317 aa  246  3e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  43.03 
 
 
317 aa  246  6e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  40.44 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  31.74 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  29.86 
 
 
222 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  25.07 
 
 
340 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 
314 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  32.89 
 
 
648 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.85 
 
 
217 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  30.52 
 
 
217 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  27.85 
 
 
217 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  23.95 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  29.55 
 
 
247 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  35.09 
 
 
239 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  30.82 
 
 
221 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  35.48 
 
 
246 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  30.5 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  30.5 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  30.5 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  31.08 
 
 
209 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  34.04 
 
 
243 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  30.94 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0231  hypothetical protein  28.67 
 
 
230 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.317475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  31.76 
 
 
209 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  32.1 
 
 
230 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  28.99 
 
 
185 aa  50.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  31.78 
 
 
224 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  31.2 
 
 
228 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  36.14 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  33.06 
 
 
235 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  32.8 
 
 
228 aa  49.7  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  33.68 
 
 
222 aa  49.7  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  31.08 
 
 
209 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 
326 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  29.17 
 
 
212 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 
227 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  30.07 
 
 
223 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  37.33 
 
 
224 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  31.71 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
224 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  23.32 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  30.37 
 
 
229 aa  47.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  30.5 
 
 
366 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  32.21 
 
 
221 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  29.45 
 
 
243 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1070  hypothetical protein  31.03 
 
 
234 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  29.1 
 
 
225 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  38.1 
 
 
641 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  29.45 
 
 
220 aa  46.6  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  32.31 
 
 
225 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  31.69 
 
 
219 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  33.75 
 
 
217 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  27.59 
 
 
221 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  27.59 
 
 
221 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 
373 aa  46.2  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 
276 aa  46.2  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  29.5 
 
 
206 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3305  OmpA/MotB domain protein  22.78 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  28.37 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  30.32 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  29.1 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  29.5 
 
 
206 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  35.06 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0017  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.12 
 
 
427 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  58.06 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  30.83 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  28.86 
 
 
200 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  31.62 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.69 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  28.08 
 
 
198 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  38.67 
 
 
179 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  28.81 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  28.14 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  29.53 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  27.66 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  29.63 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.22 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  32.77 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  37.08 
 
 
463 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  28.87 
 
 
234 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  38.75 
 
 
255 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  34.07 
 
 
428 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  27.89 
 
 
222 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 
459 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  30.43 
 
 
227 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  28.28 
 
 
243 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  27.03 
 
 
228 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>