36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0231 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  99.57 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0231  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.317475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  25.35 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  28.5 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1361  hypothetical protein  27.85 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003240  chemotaxis protein MotB-related protein  27.8 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  33.11 
 
 		 316 aa  52  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  34.21 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  28.67 
 
 		 337 aa  50.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  34.21 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6041  flagellar motor protein  26.02 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  31.97 
 
 		 363 aa  49.7  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  23.14 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  24.44 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  34.21 
 
 		 317 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  23.68 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1070  hypothetical protein  26.29 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  26.09 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  28.75 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  22.22 
 
 		 247 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 		 427 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  29.32 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  27.86 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  25.93 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  33.33 
 
 		 525 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  29.85 
 
 		 340 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  31.75 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  23.57 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  27.82 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  31.88 
 
 		 525 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  31.88 
 
 		 525 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3148  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 371 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5051  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  21.11 
 
 		 234 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>