More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3305 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3305  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 296 aa  597  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0988  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1070  hypothetical protein  30.77 
 
 		 234 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2937  OmpA/MotB domain-containing protein  30.4 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4900  hypothetical protein  27.37 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.361677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  28.99 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  36.52 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  30.52 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  30.29 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  28.45 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.46 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  29.77 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  40.24 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  39.02 
 
 		 658 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.47 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  41.86 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  35.11 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  35.11 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  29.3 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  38.55 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  30.15 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 		 642 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6041  flagellar motor protein  35.14 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  29.37 
 
 		 218 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  34.04 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  30.21 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  30.59 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  43.9 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  39.02 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.5 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  39.77 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 768 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.08 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 481 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  39.77 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  37.8 
 
 		 890 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  29.38 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  38.55 
 
 		 576 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  37.65 
 
 		 168 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  29.93 
 
 		 169 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  37.23 
 
 		 451 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  41.03 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  37.65 
 
 		 168 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  37.65 
 
 		 168 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  29.38 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  27.63 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  29 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  41.86 
 
 		 1755 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  32.87 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  36.9 
 
 		 658 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  36.05 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.51 
 
 		 344 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  37.21 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 280 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.74 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 514 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.51 
 
 		 344 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.18 
 
 		 344 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 		 198 aa  52.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  30.38 
 
 		 242 aa  52.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.51 
 
 		 344 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  34.44 
 
 		 223 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  34.83 
 
 		 262 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  32.17 
 
 		 231 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  38.82 
 
 		 552 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  36.14 
 
 		 575 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 217 aa  52.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  34.83 
 
 		 262 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 224 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  28.39 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  35.16 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  34.83 
 
 		 262 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  34.83 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 1264 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003240  chemotaxis protein MotB-related protein  33.65 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  34.83 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  34.83 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  40 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  34.83 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  42.31 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  35.23 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  34.83 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  32.24 
 
 		 506 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  31.62 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.75 
 
 		 707 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.18 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>