109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3412 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  100 
 
 		 220 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  46.12 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  31.65 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  34.13 
 
 		 363 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  35.8 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  27.4 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  27.4 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  27.4 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  34.57 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  34.29 
 
 		 317 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  31.52 
 
 		 334 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  34.09 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0111  putative chemotaxis protein MotB  34.27 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.876361  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  31.43 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  31.74 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  29.17 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  25.48 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  24.87 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  28.37 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  27.23 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0231  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.317475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  23.43 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1008  hypothetical protein  26.11 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.03 
 
 		 607 aa  52  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1070  hypothetical protein  29.85 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  27.78 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  26.63 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0988  OmpA/MotB domain-containing protein  22.5 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2937  OmpA/MotB domain-containing protein  25.51 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.81 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  22.49 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  30.4 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  25.6 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  37.93 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  35.05 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.05 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  28.03 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  30.58 
 
 		 363 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  36.78 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  36.78 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  32.48 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05164  hypothetical protein  29.06 
 
 		 301 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  36.25 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 180 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.23 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  27.34 
 
 		 352 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  35.05 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  35.05 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  32.56 
 
 		 1793 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 637 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  38.75 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  34.44 
 
 		 286 aa  45.1  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  27.46 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  29.79 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  29.79 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  32.29 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.43 
 
 		 609 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  31 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6041  flagellar motor protein  26.16 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  37.18 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  29.92 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  26.8 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.08 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  28.79 
 
 		 669 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  29.45 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  36.47 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  31.15 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  27.46 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  29.92 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  35.45 
 
 		 358 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  40.48 
 
 		 367 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  32.46 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  31.68 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  28.05 
 
 		 734 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  27.42 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0728  OmpA domain-containing protein  32.56 
 
 		 195 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0826309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  37.36 
 
 		 351 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  32.2 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  29.37 
 
 		 168 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  32.67 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  28.26 
 
 		 166 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 		 185 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  29 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 		 215 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  30.19 
 
 		 212 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 225 aa  42  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  26.79 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  31.25 
 
 		 168 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>