85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3786 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  100 
 
 
243 aa  493  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003240  chemotaxis protein MotB-related protein  64.04 
 
 
244 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1361  hypothetical protein  63.16 
 
 
244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6041  flagellar motor protein  45.75 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2937  OmpA/MotB domain-containing protein  32.93 
 
 
259 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0988  OmpA/MotB domain-containing protein  31.1 
 
 
296 aa  111  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1070  hypothetical protein  30.04 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  24.1 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3305  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  31.72 
 
 
330 aa  58.5  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  43.18 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  32.12 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  23.57 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  27.46 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  22.3 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  29.57 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  23.65 
 
 
235 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  29.05 
 
 
259 aa  49.3  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  25.95 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  29.85 
 
 
341 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  29.29 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  29.07 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  25.19 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  24.31 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  27.14 
 
 
277 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  29 
 
 
266 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  26.8 
 
 
240 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  23.77 
 
 
222 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  28.22 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  24.37 
 
 
235 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.26 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  24.37 
 
 
235 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  23.95 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0286  flagellar motor protein MotB  22.78 
 
 
260 aa  45.8  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  33.72 
 
 
326 aa  45.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  24.56 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  36.78 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  26.05 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  28.05 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  34.07 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  34.07 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  23.35 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  27.27 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  29.52 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  36.49 
 
 
1029 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  26.91 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  28.28 
 
 
337 aa  43.9  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  35.14 
 
 
1029 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  26.18 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  27.33 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  25.78 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1008  hypothetical protein  22.18 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  23.96 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 
587 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  29.45 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  35.16 
 
 
271 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  25.79 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1018  OmpA/MotB domain protein  37.78 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  33.33 
 
 
648 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  26.29 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  32.58 
 
 
374 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  26.29 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  28.36 
 
 
341 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  26.57 
 
 
317 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  32.39 
 
 
334 aa  42.7  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  28.99 
 
 
343 aa  42.4  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  32.98 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  25 
 
 
262 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  31.91 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  25 
 
 
262 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  28.89 
 
 
342 aa  42.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  35.35 
 
 
318 aa  42.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  26.57 
 
 
317 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  28.36 
 
 
341 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  32.22 
 
 
784 aa  42  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  34.52 
 
 
329 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  24.4 
 
 
289 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  35.14 
 
 
1029 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  26.02 
 
 
230 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  25.73 
 
 
253 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  28.89 
 
 
525 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  29.27 
 
 
309 aa  42  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>