37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4617 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  70.73 
 
 		 246 aa  362  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  60.66 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1008  hypothetical protein  39.09 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  42.61 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  41.89 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  35.98 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  29.26 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  28.4 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  30.49 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003240  chemotaxis protein MotB-related protein  28.17 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  26.05 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  28.4 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1361  hypothetical protein  27.46 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  27.23 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  31.25 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  29.55 
 
 		 337 aa  53.5  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0111  putative chemotaxis protein MotB  31.63 
 
 		 366 aa  52  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.876361  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  27.54 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  22.3 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  24.08 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  24.08 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  24.08 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1070  hypothetical protein  25.41 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  24.36 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 385 aa  45.8  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0231  hypothetical protein  22.22 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.317475  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  24.29 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  22.22 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  26.29 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  31.25 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6041  flagellar motor protein  21.85 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  27.19 
 
 		 159 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  26.06 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5401  hypothetical protein  22.97 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3560  hypothetical protein  22.97 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227578  normal  0.135596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5082  hypothetical protein  24.15 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.343747  normal  0.389351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>