32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1361 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1361  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003240  chemotaxis protein MotB-related protein  97.94 
 
 		 244 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  63.16 
 
 		 243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6041  flagellar motor protein  46.64 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2937  OmpA/MotB domain-containing protein  31.1 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0988  OmpA/MotB domain-containing protein  26.47 
 
 		 296 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1070  hypothetical protein  27.49 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  27.46 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  25.7 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  27.78 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  27.54 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0231  hypothetical protein  27.85 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.317475  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  23.96 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3305  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  25.98 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3029  hypothetical protein  27.07 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  22.03 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  26.42 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  30.77 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  29.38 
 
 		 299 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  22.65 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  27.31 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  29.93 
 
 		 321 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2456  hypothetical protein  28.57 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  23.21 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3587  chemotaxis protein MotB  24.17 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 385 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  31.97 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  27.57 
 
 		 337 aa  42.4  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  26.09 
 
 		 222 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03061  hypothetical protein  24.12 
 
 		 215 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>