34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003240 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003240  chemotaxis protein MotB-related protein  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1361  hypothetical protein  97.94 
 
 
244 aa  490  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  64.04 
 
 
243 aa  317  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6041  flagellar motor protein  46.22 
 
 
254 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2937  OmpA/MotB domain-containing protein  31.1 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0988  OmpA/MotB domain-containing protein  27.17 
 
 
296 aa  89  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1070  hypothetical protein  27.89 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  28.17 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  26.64 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  26.9 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  27.48 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0231  hypothetical protein  27.8 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.317475  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  25 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  25.34 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3305  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  23.53 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  24.8 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3029  hypothetical protein  25.97 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  26.94 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  30.13 
 
 
330 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  22.69 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  30.61 
 
 
321 aa  45.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  28.25 
 
 
299 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  32.65 
 
 
314 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  26.51 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3587  chemotaxis protein MotB  25.35 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2456  hypothetical protein  28.57 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916967  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2246  hypothetical protein  30.53 
 
 
286 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000018454  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  23.89 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  21.94 
 
 
218 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  25.55 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  27.57 
 
 
337 aa  42  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  26.57 
 
 
229 aa  42.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  24.86 
 
 
385 aa  42  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>