More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0148 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0148  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.704024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0433  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  93.44 
 
 		 244 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.024543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4263  ABC transporter related  74.59 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000111529  hitchhiker  0.0000623883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3818  ABC transporter-related protein  55.42 
 
 		 249 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.356438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2004  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  41.18 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  41.3 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2666  ABC transporter related  41.03 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3017  ABC transporter related  41.2 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  40.52 
 
 		 484 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2593  ABC transporter-related protein  36.69 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479665  normal  0.611604 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  40.5 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3205  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.79 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0806  ABC transporter related  38.02 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  37.96 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.52 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2775  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  37.23 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  31.93 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  38.84 
 
 		 272 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0352  ABC transporter related  37.22 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0703  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.41 
 
 		 302 aa  164  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  37.5 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  36.51 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  39.34 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1956  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.77 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  38.08 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  36.63 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1503  ABC transporter related  35.9 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3801  ABC transporter related  36.29 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  37.3 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  37.3 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  33.47 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  40.08 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4449  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.112692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  38.62 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1820  ABC transporter related protein  33.87 
 
 		 252 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.257202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1286  ABC transporter related  36.32 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 271 aa  158  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  36.95 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  37.18 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  39.27 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  38.96 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.25 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.27 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  37.25 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  37.25 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  37.25 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  35.86 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  37.25 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  35.6 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2327  ABC transporter related  35.68 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.47517  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2288  ABC transporter related  35.68 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2335  ABC transporter related  35.68 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448695  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  34.02 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3378  ABC transporter related  36.4 
 
 		 291 aa  154  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  39.02 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  33.06 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  34.1 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  32.93 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  39.58 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3490  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (urea/amide)  33.88 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2972  response regulator receiver domain-containing protein  34.89 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.85607  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  34.15 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3319  ABC transporter related  40.79 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1258  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.974612  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.41 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3686  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.82 
 
 		 287 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.14227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0951  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.66 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5756  ABC transporter related  36.24 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638783  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  37.05 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  41.41 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  34.43 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  39.41 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2698  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  35.29 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.358687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  37.08 
 
 		 863 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2254  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.24 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0954  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  34.75 
 
 		 292 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  36.69 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  36.29 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1401  ABC transporter related  37.97 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4608  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  36.21 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  39.17 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  36.29 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3590  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.86 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  37.65 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  40.97 
 
 		 233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2430  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.62 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  35.47 
 
 		 247 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0951  ABC transporter related  33.73 
 
 		 283 aa  151  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  36.55 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  37.35 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  35 
 
 		 286 aa  151  8.999999999999999e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  34.02 
 
 		 250 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>