More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4907 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  65.15 
 
 		 247 aa  338  4e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  63.9 
 
 		 247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.07 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  64.17 
 
 		 247 aa  331  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2972  response regulator receiver domain-containing protein  62.5 
 
 		 248 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.85607  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  61.83 
 
 		 247 aa  328  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  63.49 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  62.92 
 
 		 247 aa  325  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1255  ABC transporter related  63.07 
 
 		 251 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3861  ABC transporter related  63.07 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  62.55 
 
 		 251 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3115  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  61.89 
 
 		 248 aa  320  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3590  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 		 247 aa  319  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0657  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.83 
 
 		 251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2202  ABC transporter  63.49 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0320051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3569  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  59.16 
 
 		 262 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.376374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3378  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  59.16 
 
 		 262 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3687  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  59.16 
 
 		 262 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2415  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.49 
 
 		 245 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5509  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  62.14 
 
 		 261 aa  316  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  61.41 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00618326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0596  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  61.83 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393475  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  59.2 
 
 		 252 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  61 
 
 		 247 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3735  ABC transporter related  61 
 
 		 247 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4633  ABC transporter related  61 
 
 		 247 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2865  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.51 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1820  ABC transporter related protein  51.23 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.257202  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3490  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (urea/amide)  53.66 
 
 		 251 aa  261  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2998  ABC transporter related  54.96 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0191  ABC transporter related  57.02 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  52.26 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1022  ABC transporter related  55.19 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216915  normal  0.173863 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4020  ABC transporter related  52.48 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768317  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0127  ABC transporter related  53.06 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00884  ABC transporter-like protein  54.13 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2698  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  55.56 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.358687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0951  ABC transporter related  52.73 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4187  ABC transporter related  53.53 
 
 		 250 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1396  ABC transporter related  53.31 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3315  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.22 
 
 		 251 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3378  ABC transporter related  54.13 
 
 		 291 aa  252  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3060  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.07 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.963696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  51.64 
 
 		 246 aa  251  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.51 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3497  ABC transporter-related protein  53.31 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0603668  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.31 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4636  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.4 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.880683  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4901  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.4 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  54.4 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2004  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  48.43 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2775  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.85 
 
 		 254 aa  248  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  57.32 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4844  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.4 
 
 		 285 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4226  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.81 
 
 		 257 aa  248  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0369826  normal  0.231992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1942  ABC transporter related  50.41 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4722  ABC transporter related  52.4 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.194668  hitchhiker  0.00869396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3208  ABC transporter related  52.65 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1000  ABC transporter related  52.07 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4152  ABC transporter related  53.11 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3934  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.85 
 
 		 288 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1424  ABC transporter-related protein  50.39 
 
 		 268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  50.82 
 
 		 506 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0996  ABC transporter related  49.59 
 
 		 247 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3507  ABC transporter related  51.65 
 
 		 254 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4888  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.59 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0298  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5582  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtD  53.12 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2617  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.64 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.28 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000680503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4188  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.24 
 
 		 254 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2870  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  48.64 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0170195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1337  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.64 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.932166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2791  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.64 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0991  ABC transporter related  51.04 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64300  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.12 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1100  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.89 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2310  ABC transporter related  53.11 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1991  ABC transporter related  51.61 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.662576  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7015  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.04 
 
 		 253 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.61355  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4608  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.64 
 
 		 261 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27919  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3699  ABC transporter related  50.83 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1258  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.974612  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  52.07 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1797  ABC transporter related  51.24 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1956  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 		 247 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4429  ABC transporter  50.79 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0587  ABC transporter-like  51.45 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2158  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  52.05 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0700  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.03 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1435  ABC transporter related  53.11 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0703  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  55.23 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2743  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  48.43 
 
 		 263 aa  238  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2497  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  51.21 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0109341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1087  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  53.09 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  52.48 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0698  ABC transporter related  52.28 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0826  ATPase  48.15 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.968088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>