More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4263 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4263  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000111529  hitchhiker  0.0000623883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0148  ABC transporter related  74.59 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.704024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0433  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  73.77 
 
 		 244 aa  371  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.024543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3818  ABC transporter-related protein  54.24 
 
 		 249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.356438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2666  ABC transporter related  43.16 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  39.13 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1503  ABC transporter related  38.72 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3017  ABC transporter related  41.67 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3205  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.54 
 
 		 238 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1286  ABC transporter related  38.3 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  38.87 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  37.15 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  38.25 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  37.15 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0806  ABC transporter related  38.17 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  36.8 
 
 		 506 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  38.84 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0352  ABC transporter related  39.01 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0229  histidine kinase  34.31 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.68 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  35.63 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2004  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.83 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2865  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  36.18 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.25 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2775  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  35.54 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  36.65 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  36.65 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  36.65 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19161  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  32.93 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.651174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1045  ATPase  32.93 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  38.3 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.59 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2310  ABC transporter related  38.06 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0703  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  37.87 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  38.82 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  35.86 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.53 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00618326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.46 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4449  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.85 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.112692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3319  ABC transporter related  39.09 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  39.13 
 
 		 484 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5756  ABC transporter related  37.99 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638783  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2998  ABC transporter related  36.18 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  39.76 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  36.14 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  35.44 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  35.2 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  37.29 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3115  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  35.74 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  35.46 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  35.1 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4226  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  37.13 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0369826  normal  0.231992 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2247  ATPase  35.63 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  35.66 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  35.92 
 
 		 863 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2593  ABC transporter-related protein  36.55 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479665  normal  0.611604 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2989  ABC transporter ATP-binding protein  35.44 
 
 		 271 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0657  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.89 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  35.46 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08851  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  32.38 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  34.6 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00884  ABC transporter-like protein  34.6 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  36.02 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  34.4 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2415  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2202  ABC transporter  35.66 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0320051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  39.27 
 
 		 252 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3861  ABC transporter related  34.6 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0191  ABC transporter related  34.55 
 
 		 280 aa  154  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  38.4 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  33.6 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  35.47 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  35.25 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  33.6 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  39.36 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4020  ABC transporter related  36.13 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768317  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  37.97 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  38.66 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3686  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.56 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.14227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3590  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  33.06 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1255  ABC transporter related  34.6 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  35.2 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  36.97 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0951  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.14 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1956  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.04 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  37.45 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08831  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  31.97 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  36.55 
 
 		 244 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1820  ABC transporter related protein  32.53 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.257202  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  33.88 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.44 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  36.91 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>